Basic Information

Symbol
PIEZO1
RNA class
mRNA
Alias
Piezo Type Mechanosensitive Ion Channel Component 1 (Er Blood Group) Piezo-Type Mechanosensitive Ion Channel Component 1 KIAA0233 FAM38A Membrane Protein Induced By Beta-Amyloid Treatment Family With Sequence Similarity 38, Member A Mib Piezo Type Mechanosensitive Ion Channel Component 1 Protein FAM38A LMPHM6 LMPH3 DHS ER
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Other applications

MANE select

Transcript ID
NM_001142864.4
Sequence length
8089.0 nt
GC content
0.6433

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3743.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3863.51 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1690.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
GGGAGCCGCCGUCCGGCCCAGCUCGGCCCCAGUGAGCCGAGCGCUGCGC… 8089 nt 0.6433
Summary

The protein encoded by this gene is a mechanically-activated ion channel that links mechanical forces to biological signals. The encoded protein contains 36 transmembrane domains and functions as a homotetramer. Defects in this gene have been associated with dehydrated hereditary stomatocytosis. [provided by RefSeq, Jul 2015]

Forensic Context

A study in human menstrual blood-derived mesenchymal stem cells demonstrated that the PIEZO1 mRNA expression was remarkably increased in cells from endometriosis patients compared to those from healthy women [Sahraei et al. DOI:10.1155/2022/7053521].