Basic Information

Symbol
PIGR
RNA class
mRNA
Alias
Polymeric Immunoglobulin Receptor Poly-Ig Receptor Hepatocellular Carcinoma Associated Protein TB6 Hepatocellular Carcinoma-Associated Protein TB6 PIgR
Location (GRCh38)
1:206928522-206949367
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002644.4
Sequence length
4275.0 nt
GC content
0.5387

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1611.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1684.57 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1302.07
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002644.4 NCBI
GAGCAGAGUUUCAGUUUUGGCAGCAGCGUCCAGUGCCCUGCCAGUAGCU… 4275 nt 0.5387
Summary

This gene is a member of the immunoglobulin superfamily. The encoded poly-Ig receptor binds polymeric immunoglobulin molecules at the basolateral surface of epithelial cells; the complex is then transported across the cell to be secreted at the apical surface. A significant association was found between immunoglobulin A nephropathy and several SNPs in this gene.[provided by RefSeq, Sep 2009]

Forensic Context

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