Basic Information

Symbol
PIK3C3
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylinositol 3-Kinase Catalytic Subunit Type 3 HVps34 Vps34 Phosphatidylinositol 3-Kinase P100 Subunit Vacuolar Protein Sorting 34 Homolog Phosphoinositide-3-Kinase, Class 3 PtdIns-3-Kinase Type 3 PI3-Kinase Type 3 EC 2.7.1.137 PI3K Type 3 Phosphatidylinositol 3-Kinase, Catalytic Subunit Type 3 Phosphoinositide-3-Kinase Class 3 EC 2.7.1 VPS34
Location (GRCh38)
18:41955207-42087830
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002647.4
Sequence length
9415.0 nt
GC content
0.3828

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2472.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2657.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2309.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308020.2 NCBI
AUGUUGUUUUUCCUGUACCUAAGUUCCCGCUGUAGGUGGUACCUUUGCA… 9226 nt 0.3822
NM_002647.4 NCBI
AUGUUGUUUUUCCUGUACCUAAGUUCCCGCUGUAGGUGGUACCUUUGCA… 9415 nt 0.3828
Summary

Enables 1-phosphatidylinositol-3-kinase activity. Involved in several processes, including early endosome to late endosome transport; macroautophagy; and phosphatidylinositol-3-phosphate biosynthetic process. Acts upstream of or within autophagy and positive regulation of protein lipidation. Located in autolysosome; late endosome; and midbody. Part of phosphatidylinositol 3-kinase complex, class III. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that chronic methamphetamine administration significantly dysregulates the PIK3C3 in microglia, as part of broad transcriptomic alterations affecting autophagy, ubiquitin-mediated proteolysis, and mitophagy pathways [Oladapo et al. DOI:10.3390/Ijms26020649].