Basic Information

Symbol
PIM2
RNA class
mRNA
Alias
Pim-2 Proto-Oncogene, Serine/Threonine Kinase Serine/Threonine-Protein Kinase Pim-2 Pim-2 Oncogene EC 2.7.11.1 Pim-2h Proto-Oncogene Pim-2 (Serine Threonine Kinase)
Location (GRCh38)
X:48913182-48919024
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006875.4
Sequence length
2075.0 nt
GC content
0.5508

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-788.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -821.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 470.97
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((...((((((.((((.((((((((........)))))))))))).))(((((((...(((.....(((......))).....))).))))))).(((..(.(((((.....(((((((.((((((((((....))))).).)))).....((((((...)))))).....))))))).(((((.(((((((......(((((....))))).((..((((..(((((..((.....(((.((....)).)))..)).)))))..))))..))((((((((....))))))))(((....)))...((((((((...((((((((((...))))).((((((...((.....))..))))))(((((((((((((((((.(((((.((((((((((.(((((((((((.((((((.((((((...(((((((....((.((...)).))....)))))))((((((((....(((......)))..)))))))).)))))))))))).)...))).)))......(((.(....).)))(((((((((((((((....(((((.(((.....))).))))).)))).....)))))))))))...((((((((((........)))))))))).)))))))))))).)).))))).).))))))((.((((((((.((((.(((((....)))))))))........((.(.(((...(((((((.((.......))))).)))))))).)).)))))))).)).........))))))))))......)))))..))))))))((((.(((((((.....(((((.((..((..(....)..))..)))))))....))).))))..))))..))))))).).))))(((((.((((.(((.((((((((((((((.......(((.(((((....((((((((((((......((((.(.((((.((........))))))).))))((((((((((.((((((...((((((((.(((((((...((((((((..((((.((....))))))..((((.......)))).(((...(((((((.(((...))))))))))...))).....(((((((..((.((((((((..((((((((((......))))))....))))..))).))))).))...)))).)))...(((......(((((((......)))))))......)))......))))))))((((....))))(((((((.(((..(((((.....((((.........)))).......)))))))))))))))..(((((((((((((((((((((.(..........).)))))).))))(((((((((((..........))..)))))))))....(((.(((....))))))..(((((...((((..............((((((......))))))(((((((...((((..............)))).....(((((......))))).)))))))................((((((((....(((((((..((((((((............)))))))).)))))))..))))))))..)))).)))))((((((((.....))))))))((.((((((........)))))))))))))))))))..........))))))).))))))))...(((.........((((((((.....(((...((((((......))))))...))))))))))))))...)))))).))..(((((((....(((((........)).)))..))).))))..))))))))))))))).))))).....))))))))......)))))))).....)))))))))...((((((....)))))).(((.....)))..)))).))))).............(((((((((..(((....(((((((((((..((....).)..)))))))))))...)))...)))))))))...))))).)..)))...))))))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
.,,{({..{((((({((((.((((((((........))))))))))}}.},(((((((...(((.....(((......))).....))).))))))).|||}}|}|{|||.,,,.|{{{{((,(((({(((((....))))).).))))..,}}|{{{{{,{{|||}},..,{{|||||||.(((((.(((((((......(((((....))))).((..((((..(((({,.,{|,,..(((.((....)).)))..)).}))))..))))..}}((((((((....))))))))(((....)))...((((((((...((((((((({...})))).((((((...,{.....}}..))))))(((((((((((((((({,(((((.((((((((((.((((((((((({((((((.((((((...((((((({..{((.,,...))},).,..)))))))((((((((...{(,,....},}),..)))))))).)))))))))))}.},,.))).)))......(((.(....).)))(((((((((((((((....(((((.(((.....))).))))).)))).....)))))))))))...((((((((((........)))))))))).)))))))))))).)).))))).).)))))){{.((((((((.(((,{(((((....)))))))))........((.(.(((.,.(((((({{(,..,,.,})))),.}})})))}.)).)))))))).}}.........))))))))))......)))))..))))))))((((.((((,{(,.,..{((((.((,,,((.,....}},...,)}}))))..},))).))))..))))..))))))).).))))(((((.((((.{((.((((((((((((((....,..(((.(((((....((((((((((((......((((.,.((((.((........))))))).))))((((((((((,(({((((..((((((((.(((((((...{(((((((..((((.((....}}))))..((((.......))))..,,...(((((((.(((...))))))))))...}||{{,{.(((((((..((.((((((((..((((((((((......))))))....))))..))).))))).))...)))).))),,||||.,,{{.(((((((,,....}}}}}}}..)}}})))}.},,,)))))))}{(((....))))(((((((.(((..(((((...,.((((.........)))).......)))))))))))))))..(((((((((((((({{(((((.{.,.,,,,,|.}.}}}}}||}}||(((({{(((((,.........}}..,))))))}}....{{{,{||}..}))))),.,||{|{...,|||},,,...,,,,}..((,((({{{...,,,,,)}|}}}.}}..,,,...............,}}}.....{((((......))))}.(((({.,..........,}}}}.((((((((....(((((((..((((((((............)))))))).)))))))..))))))))..,,||,|||,,((((((((.....)))))))){|,||||{{|,......}}}}}}})))))))))))}..........})))))).)))))))){{,........},,,{{({.((({.{,,...(((((((.{.....{{,,.((((({{..,,|.}}}}),.}}))}}},.|}...,}}}))},...}}}}))})))).)),))))).))).))),..}))))))))))))).})))),....)))))))).,,.,.)))))))).....))))))))}...{(((({....}))))}.{({.....)))..)))).)))))...,,{......,||(((((((..({{..{.(((((((((((..,{....,.)..))))))))))).,.}}}.,,)))))))}}...,)),,,)}|))),..)))))|||,..........,...,........

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_006875.4 NCBI
AGUAGCAUUGGGGCUGGCGCGCGCGGCGAAUCUCAACGCUGCGCCGUCU… 2075 nt 0.5508
Summary

This gene encodes a protooncogene that acts as a serine/threonine protein kinase. Studies determined the encoded protein functions to prevent apoptosis and to promote cell survival.[provided by RefSeq, Nov 2009] CIViC Summary for PIM2 Gene

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.