Basic Information

Symbol
PINK1
RNA class
mRNA
Alias
PTEN Induced Kinase 1 BRPK Serine/Threonine-Protein Kinase PINK1, Mitochondrial PTEN-Induced Putative Kinase Protein 1 PTEN Induced Putative Kinase 1 PARK6 Parkinson Disease (Autosomal Recessive) 6 Protein Kinase BRPK EC 2.7.11.1
Location (GRCh38)
1:20633458-20651511
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032409.3
Sequence length
2657.0 nt
GC content
0.5852

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1116.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1165.74 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 662.25
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032409.3 NCBI
AGAGGCACCGCCCCAAGUUUGUUGUGACCGGCGGGGGACGCCGGUGGUG… 2657 nt 0.5852
Summary

This gene encodes a serine/threonine protein kinase that localizes to mitochondria. It is thought to protect cells from stress-induced mitochondrial dysfunction. Mutations in this gene cause one form of autosomal recessive early-onset Parkinson disease. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PINK1 was identified as a differential wiring gene associated with cell communication in the prefrontal cortex of lines selectively bred for high versus low methamphetamine intake [Hitzemann et al. DOI:10.3390/brainsci9070155].