Basic Information

Symbol
PIP4K2A
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylinositol-5-Phosphate 4-Kinase Type 2 Alpha PIP5KIIalpha PIP5KIIA PIP5K2A Phosphatidylinositol-4-Phosphate 5-Kinase, Type II, Alpha Phosphatidylinositol 5-Phosphate 4-Kinase Type II Alpha Phosphatidylinositol 5-Phosphate 4-Kinase Type-2 Alpha 1-Phosphatidylinositol 5-Phosphate 4-Kinase 2-Alpha Diphosphoinositide Kinase 2-Alpha PI(5)P 4-Kinase Type II Alpha PIP4KII-Alpha EC 2.7.1.149 PI5P4Kalpha PIP5KIII PI5P4KA Phosphatidylinositol-5-Phosphate 4-Kinase, Type II, Alpha 1-Phosphatidylinositol-4-Phosphate-5-Kinase 1-Phosphatidylinositol-4-Phosphate Kinase Phosphatidylinositol 5-Phosphate 4-Kinase PtdIns(5)P-4-Kinase Isoform 2-Alpha PtdIns(4)P-5-Kinase B Isoform PtdIns(4)P-5-Kinase C Isoform PIP5KII-Alpha EC 2.7.1 PIP5K2 PIPK
Location (GRCh38)
10:22534854-22714578
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_005028.5
Sequence length
3820.0 nt
GC content
0.4560

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1143.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1214.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 830.22
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330062.2 NCBI
GCAGCUGCUGCGGGGCGGGGAGCCGGAGUCAGCCCUGGACCUCCGGCUG… 3597 nt 0.4381
NM_005028.5 NCBI
AGCCGCGGGCUGAGCGCGGAUCCGCGGCGGGCGCAGGAUACGGGCCGGG… 3820 nt 0.4560
Summary

Phosphatidylinositol-5,4-bisphosphate, the precursor to second messengers of the phosphoinositide signal transduction pathways, is thought to be involved in the regulation of secretion, cell proliferation, differentiation, and motility. The protein encoded by this gene is one of a family of enzymes capable of catalyzing the phosphorylation of phosphatidylinositol-5-phosphate on the fourth hydroxyl of the myo-inositol ring to form phosphatidylinositol-5,4-bisphosphate. The amino acid sequence of this enzyme does not show homology to other kinases, but the recombinant protein does exhibit kinase activity. This gene is a member of the phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase family. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human pediatric sepsis patients identified the PIP4K2A as a gene exhibiting decreased polyadenylation in viral compared to bacterial infection samples, and it was confirmed as one of two robustly differentially polyadenylated biomarkers via bootstrapping sensitivity analysis [He et al. DOI:10.1186/s12879-025-11078-z].