Basic Information

Symbol
PIP4K2B
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylinositol-5-Phosphate 4-Kinase Type 2 Beta PIP5KIIbeta PIP5KIIB PIP5K2B Phosphatidylinositol-4-Phosphate 5-Kinase, Type II, Beta Phosphatidylinositol 5-Phosphate 4-Kinase Type II Beta Phosphatidylinositol 5-Phosphate 4-Kinase Type-2 Beta 1-Phosphatidylinositol 5-Phosphate 4-Kinase 2-Beta Diphosphoinositide Kinase 2-Beta PI(5)P 4-Kinase Type II Beta PIP4KII-Beta EC 2.7.1.149 Phosphatidylinositol-5-Phosphate 4-Kinase, Type II, Beta 1-Phosphatidylinositol-4-Phosphate Kinase PtdIns(5)P-4-Kinase Isoform 2-Beta PTDINS(4)P-5-Kinase PIP5P4KB EC 2.7.1 PI5P4KB
Location (GRCh38)
17:38765691-38800126
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_003559.5
Sequence length
5383.0 nt
GC content
0.5151

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1929.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2027.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1615.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_003559.5 NCBI
AACGGGACGGGCGCGACCAUGGCGCGGUGAGGGAGCGGGGGUGGGGAUC… 5383 nt 0.5151
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the phosphorylation of phosphatidylinositol-5-phosphate on the fourth hydroxyl of the myo-inositol ring to form phosphatidylinositol-5,4-bisphosphate. This gene is a member of the phosphatidylinositol-5-phosphate 4-kinase family. The encoded protein sequence does not show similarity to other kinases, but the protein does exhibit kinase activity. Additionally, the encoded protein interacts with p55 TNF receptor. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the PIP4K2B was identified as a potential regulator of methamphetamine reward and addiction via RNA-sequencing of whisker follicles, showing an up-down expression pattern (1.46-fold after self-administration, 0.74-fold after withdrawal) and a betweenness centrality score of 0.0136, with prior reports linking it to addiction-related pathways [Song et al. DOI:10.1038/s41598-018-29772-1].