Basic Information

Symbol
PIP5K1A
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylinositol-4-Phosphate 5-Kinase Type 1 Alpha 68 KDa Type I Phosphatidylinositol 4-Phosphate 5-Kinase Alpha Phosphatidylinositol 4-Phosphate 5-Kinase Type-1 Alpha Phosphatidylinositol 4-Phosphate 5-Kinase Type I Alpha PtdIns(4)P-5-Kinase 1 Alpha PIP5K1-Alpha PIP5KIalpha EC 2.7.1.68 Phosphatidylinositol-4-Phosphate 5-Kinase, Type I, Alpha EC 2.7.1
Location (GRCh38)
1:151197949-151249538
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001135638.2
Sequence length
3800.0 nt
GC content
0.4716

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1235.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1309.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 946.20
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135636.2 NCBI
GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3680 nt 0.4726
NM_001135637.2 NCBI
GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3614 nt 0.4696
NM_001135638.2 NCBI
GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3800 nt 0.4716
NM_001330689.2 NCBI
GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3764 nt 0.4721
NM_003557.3 NCBI
GAUUUUUUGCUUGGCUACCCGGAGUGAAGCGGCCGGGUUGGGCGAUUAA… 3761 nt 0.4719
Summary

Enables 1-phosphatidylinositol-4-phosphate 5-kinase activity and kinase binding activity. Involved in several processes, including activation of GTPase activity; focal adhesion assembly; and ruffle assembly. Located in several cellular components, including lamellipodium; nucleus; and ruffle membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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