Basic Information

Symbol
PISD
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylserine Decarboxylase DJ858B16.2 PSDC Phosphatidylserine Decarboxylase Proenzyme, Mitochondrial EC 4.1.1.65 DJ858B16 LIBF PSSC PSD
Location (GRCh38)
22:31618489-31662239
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001326411.2
Sequence length
2358.0 nt
GC content
0.5509

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-876.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -919.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 544.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((.(.((((((((((.....(((..((((((...((.(((((((.(((.(.((.((((....))))..))).))).)......)))))).)).)))))).))))))).)))))).).)))).(((((((.(((((((.(((((((((((....((((.((((((..(((((....((((..(((((((((((.((.((.......)).)).)))..))))))))))))..)))))..)))))).)).)).(((((((.((((((((((.....))))(((..((((...)))))))...))))))(((((((....))))))).....(((((..((....))..)))))((((.(((((((((...((((((.....)))))).((.((((...)))).)).)))))))))..))))))))))).))))).))))))((((.(((((((((..(((((((...((((...(((.........))).)))))))((((((((((((((.(((((((((..((((((((((.......(((((((.((((((((.(...(((((..(...(((....)))....)..))))).(((.....)))((((((.(((((......(((((((.....)))))))((((((..(((.(((((.(.(((.((((((((((......((((((((((((((.(.((....(((.....)))...))).)))))).....))))))))......)))......)))).))).)))).)))))..))))))).))..((.(((((.((((((.(((...((((...))))...))).((((....(((((.((.(((....))).))..)))))..)))).....((((((....((((............))))...))))))....)))))).))))).))..))))).))))))).)).)))))).)))))))(((.((((((.......))..)))).))).))))).)))))........(((((...((...))..)))))..........))))))))))))..............((((((.(((((.((.((......))((((((.(((..(((((((...)))))))..)))..))))))......((((((...((((((........(((((.((((((((..(((....((.(.((((((((((((((.(((..(((....((((........))))..))).))).))))..))))))))))).))(((((((.........((((.((((((.....(((.....)))..)))))).))))((.(((((...(((((....(((((...)))))...)))))....)))))))......((((.((((.(((((((.(((((.((((................................................((((((((((((((.((((.(((......))))))).)))).....((((....))))...))))))))))...((((((........))))))..)))).))))).))))))))))).))))..))).)))))))..)))))))).)))))........)))))).))))))..(((.((((.....)))))))..(((((.....)))))....)).)))))))))))(((((((.(.(((((((.((((..((....)).......((((((((((..(((......(((((..........))))).....)))..)))))..))))).....(((((.((((((.(((((((((...)))))))))....((.(((((.((........(((((((((((((((.(.(((..((.....)).))).).)))))))..))))).)))........)).))))).))....((((....)))).))))))...))))).))))..)).)).))).).)))))))...)))))))))))((((((((..((((...((((............))))........((((((.(((.(((((((((((...))))...))))))).))).)))))).((((.((((((((.((((........)))).)))))..))).))))(((((...))))))))).))))))))))))...))))))))).)))).((((((((((((..(((((((....)))))))......((((....))))((((...))))..)))))))))))).........))))))).).))))))..((((((.....)))))).....))))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{{(({((((.{.((((((((((.....(((..((((((...((.(((((({,(({.(.((.((((....)))).,}.}.))).,......)))))).)).)))))).)))))))},))))).}.)))).(((((((.(((((((.(((((((((((....{(((.((((((..(((((....{{{|..(((((((({{,.(({(({,,....|,|)).)})}})))))))),))),.)))))..)))))).)).)}.(((((((.((((((((((.....))))(((..((((...)))))))...))))))(((((((....)))))))....,{,{{{.{((((....))))).}|{({.(((((((((.,.{(((({.....})))}|.{{.{{{|...)))).)).)))))))))..)))}))))))).))))).))))))((((.(((((((((..((((((({,,((((...(((.........))).))})}))|{{((((((({((({(((((((((.,((((((((((,,,({..(((((((.((((((,(,....(((((..{{,.(((....))),,..,..))))).({{.....})}((((((.(((((......(((((((.....)))))))({{(({{{(((,(((((.(.(((.(((((((({(,.,...((((((((((((((.(.{({.,.{({.....})).},,}).)))))).....))))))))...,..}))}....})))).))).)))).)))))..))))))},)}.,{{.(((((.((((((.,((...((((...}}||,..|||,((({....,{(((,((,{((,{.{|||.||..|}}}}.,}))||||}|||,|||..|,||||...,,|,.....)}))})))))))),}..)))))).))))).)}.,))))).)))))),.}),)))))).)))))))..}}|{||({.......)).,|,,,...).))))).)))))........(((((..,{{...})..)))))........}.))))))))).})}.},,.........((((((((((((.((.{(,..{(({.((((((.(((,.(((((({...})))))),.)))..)))))).)))}.((((((...((((((........(((((.((((((((..(((.....,,{,((((((((((((((.(((..(((.,,,{(((........)))}..))).))}.))))..}})))))}},,.}}|{|{(((,,,,,,...((((.((((((.....(((.....)))..)))))).)))){{.(((((.({(,{,{.{{.(((((.{{|,|||{,.,,)))},..,))))))}.,,..((((.((((.(((((((.((((,{(,,,....}}.}}}}}}}}..........{{{,,.,{{{{,,..........||{|||||{{||||,((((.(((......}}))))).,)}},....{||{....))||,,,|||}}|||}},..((((((,{......))))))..))})}),))),))))))))))).)))).,))}})))))))..)))))))).)))))........)))))).))))))..{((.((((.....)))))}}..(((((.....)))))....}).)))))))))))(((((((.{.((({({{.((({..{{{...,,,{,....((((((((((..(((......(((((.{{....,}.))))).....)))..)))))..))))).....(((((.((((((.(((((((({...}))))))))....{{.(((({.,{......,.(((((((((((((((.(.(((..{(.....)).))).).))))))),.})))).))),.......}}.}}))}.}}....((((....)))).))))))...))))),)))},})).)).))).}.)))))))...,))))))}}))((((((((..((((...((((............))))........((((((.(((.((((((({(((...}}}))},,)))))).))).)))))).{(((.({((((({.{({(,{{...,,)))}.}))))..)}).))))(((((...))))))))).))))))))))))...))))))))).)))),{(((((((((((..(((((((....)))))))......((((....)))){(((...))))..)))))))))))}.........))))))).}}})))))..((((((.....})))))....,}}}})}........................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001326411.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2358 nt 0.5509
NM_001326412.1 NCBI
GAUGCCCAGUUUCCCCAUCCGUAAAAUGAGCAAGUUCGAUCACUUGAAA… 2644 nt 0.5533
NM_001326413.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2444 nt 0.5589
NM_001326414.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2524 nt 0.5590
NM_001326415.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2698 nt 0.5667
NM_001326416.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2887 nt 0.5663
NM_001326417.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2778 nt 0.5666
NM_001326418.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2278 nt 0.5505
NM_001326419.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2664 nt 0.5664
NM_001326420.2 NCBI
AGACAAGAUGGCGACGUCCGUGGGGCACCGAUGUCUGGGAUUACUGCAC… 2164 nt 0.5494
Showing 1 to 10 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the conversion of phosphatidylserine to phosphatidylethanolamine in the inner mitochondrial membrane. The encoded protein is active in phospholipid metabolism and interorganelle trafficking of phosphatidylserine. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PISD gene was downregulated during long-term (0 to 12 months) weight loss in subcutaneous adipose tissue of weight losers [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].