Basic Information

Symbol
PISD
RNA class
mRNA
Alias
Phosphatidylserine Decarboxylase DJ858B16.2 PSDC Phosphatidylserine Decarboxylase Proenzyme, Mitochondrial EC 4.1.1.65 DJ858B16 LIBF PSSC PSD
Location (GRCh38)
22:31618489-31662239
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001326411.2
Sequence length
2358.0 nt
GC content
0.5509

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-876.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -919.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 544.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((((((.(.((((((((((.....(((..((((((...((.(((((((.(((.(.((.((((....))))..))).))).)......)))))).)).)))))).))))))).)))))).).)))).(((((((.(((((((.(((((((((((....((((.((((((..(((((....((((..(((((((((((.((.((.......)).)).)))..))))))))))))..)))))..)))))).)).)).(((((((.((((((((((.....))))(((..((((...)))))))...))))))(((((((....))))))).....(((((..((....))..)))))((((.(((((((((...((((((.....)))))).((.((((...)))).)).)))))))))..))))))))))).))))).))))))((((.(((((((((..(((((((...((((...(((.........))).)))))))((((((((((((((.(((((((((..((((((((((.......(((((((.((((((((.(...(((((..(...(((....)))....)..))))).(((.....)))((((((.(((((......(((((((.....)))))))((((((..(((.(((((.(.(((.((((((((((......((((((((((((((.(.((....(((.....)))...))).)))))).....))))))))......)))......)))).))).)))).)))))..))))))).))..((.(((((.((((((.(((...((((...))))...))).((((....(((((.((.(((....))).))..)))))..)))).....((((((....((((............))))...))))))....)))))).))))).))..))))).))))))).)).)))))).)))))))(((.((((((.......))..)))).))).))))).)))))........(((((...((...))..)))))..........))))))))))))..............((((((.(((((.((.((......))((((((.(((..(((((((...)))))))..)))..))))))......((((((...((((((........(((((.((((((((..(((....((.(.((((((((((((((.(((..(((....((((........))))..))).))).))))..))))))))))).))(((((((.........((((.((((((.....(((.....)))..)))))).))))((.(((((...(((((....(((((...)))))...)))))....)))))))......((((.((((.(((((((.(((((.((((................................................((((((((((((((.((((.(((......))))))).)))).....((((....))))...))))))))))...((((((........))))))..)))).))))).))))))))))).))))..))).)))))))..)))))))).)))))........)))))).))))))..(((.((((.....)))))))..(((((.....)))))....)).)))))))))))(((((((.(.(((((((.((((..((....)).......((((((((((..(((......(((((..........))))).....)))..)))))..))))).....(((((.((((((.(((((((((...)))))))))....((.(((((.((........(((((((((((((((.(.(((..((.....)).))).).)))))))..))))).)))........)).))))).))....((((....)))).))))))...))))).))))..)).)).))).).)))))))...)))))))))))((((((((..((((...((((............))))........((((((.(((.(((((((((((...))))...))))))).))).)))))).((((.((((((((.((((........)))).)))))..))).))))(((((...))))))))).))))))))))))...))))))))).)))).((((((((((((..(((((((....)))))))......((((....))))((((...))))..)))))))))))).........))))))).).))))))..((((((.....)))))).....))))))........................
Thermodynamic Ensemble Prediction
...{{{(({((((.{.((((((((((.....(((..((((((...((.(((((({,(({.(.((.((((....)))).,}.}.))).,......)))))).)).)))))).)))))))},))))).}.)))).(((((((.(((((((.(((((((((((....{(((.((((((..(((((....{{{|..(((((((({{,.(({(({,,....|,|)).)})}})))))))),))),.)))))..)))))).)).)}.(((((((.((((((((((.....))))(((..((((...)))))))...))))))(((((((....)))))))....,{,{{{.{((((....))))).}|{({.(((((((((.,.{(((({.....})))}|.{{.{{{|...)))).)).)))))))))..)))}))))))).))))).))))))((((.(((((((((..((((((({,,((((...(((.........))).))})}))|{{((((((({((({(((((((((.,((((((((((,,,({..(((((((.((((((,(,....(((((..{{,.(((....))),,..,..))))).({{.....})}((((((.(((((......(((((((.....)))))))({{(({{{(((,(((((.(.(((.(((((((({(,.,...((((((((((((((.(.{({.,.{({.....})).},,}).)))))).....))))))))...,..}))}....})))).))).)))).)))))..))))))},)}.,{{.(((((.((((((.,((...((((...}}||,..|||,((({....,{(((,((,{((,{.{|||.||..|}}}}.,}))||||}|||,|||..|,||||...,,|,.....)}))})))))))),}..)))))).))))).)}.,))))).)))))),.}),)))))).)))))))..}}|{||({.......)).,|,,,...).))))).)))))........(((((..,{{...})..)))))........}.))))))))).})}.},,.........((((((((((((.((.{(,..{(({.((((((.(((,.(((((({...})))))),.)))..)))))).)))}.((((((...((((((........(((((.((((((((..(((.....,,{,((((((((((((((.(((..(((.,,,{(((........)))}..))).))}.))))..}})))))}},,.}}|{|{(((,,,,,,...((((.((((((.....(((.....)))..)))))).)))){{.(((((.({(,{,{.{{.(((((.{{|,|||{,.,,)))},..,))))))}.,,..((((.((((.(((((((.((((,{(,,,....}}.}}}}}}}}..........{{{,,.,{{{{,,..........||{|||||{{||||,((((.(((......}}))))).,)}},....{||{....))||,,,|||}}|||}},..((((((,{......))))))..))})}),))),))))))))))).)))).,))}})))))))..)))))))).)))))........)))))).))))))..{((.((((.....)))))}}..(((((.....)))))....}).)))))))))))(((((((.{.((({({{.((({..{{{...,,,{,....((((((((((..(((......(((((.{{....,}.))))).....)))..)))))..))))).....(((((.((((((.(((((((({...}))))))))....{{.(((({.,{......,.(((((((((((((((.(.(((..{(.....)).))).).))))))),.})))).))),.......}}.}}))}.}}....((((....)))).))))))...))))),)))},})).)).))).}.)))))))...,))))))}}))((((((((..((((...((((............))))........((((((.(((.((((((({(((...}}}))},,)))))).))).)))))).{(((.({((((({.{({(,{{...,,)))}.}))))..)}).))))(((((...))))))))).))))))))))))...))))))))).)))),{(((((((((((..(((((((....)))))))......((((....)))){(((...))))..)))))))))))}.........))))))).}}})))))..((((((.....})))))....,}}}})}........................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001326421.1 NCBI
GAUGCCCAGUUUCCCCAUCCGUAAAAUGAGCAAGUUCGAUCACUUGAAA… 2546 nt 0.5526
NM_014338.4 NCBI
AGUCGGAGCCCGGAAGCUGGAGCCACCUGCGGCUCUGAGAGGGACAGAC… 2690 nt 0.5651
NM_178022.2 NCBI
AUUUCCUCUCUGCCGGUCUUCUUGGCCAACAAGCGUUUCUCCCUCUUCC… 2608 nt 0.5629
Showing 11 to 13 of 13 entries
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the conversion of phosphatidylserine to phosphatidylethanolamine in the inner mitochondrial membrane. The encoded protein is active in phospholipid metabolism and interorganelle trafficking of phosphatidylserine. [provided by RefSeq, May 2016]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PISD gene was downregulated during long-term (0 to 12 months) weight loss in subcutaneous adipose tissue of weight losers [Bollepalli et al. DOI:10.1038/ijo.2017.245].