Basic Information

Symbol
PITX1
RNA class
mRNA
Alias
Paired Like Homeodomain 1 PTX1 Paired-Like Homeodomain Transcription Factor 1 POTX BFT Homeobox Protein PITX1 Pituitary Homeobox 1 Hindlimb Expressed Homeobox Protein Backfoot Hindlimb-Expressed Homeobox Protein Backfoot Pituitary Otx-Related Factor Paired-Like Homeodomain 1 Pituitary Homeo Box 1 LBNBG CCF
Location (GRCh38)
5:135027734-135034813
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002653.5
Sequence length
2337.0 nt
GC content
0.6881

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1147.48 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1181.04 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 508.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002653.5 NCBI
AAGACAGACUCUGCCGGCGCCGUCCGGAGCCUUAGAAACCGGCCCCGGA… 2337 nt 0.6881
Summary

This gene encodes a member of the RIEG/PITX homeobox family, which is in the bicoid class of homeodomain proteins. Members of this family are involved in organ development and left-right asymmetry. This protein acts as a transcriptional regulator involved in basal and hormone-regulated activity of prolactin. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.