Basic Information

Symbol
PIWIL1
RNA class
mRNA
Alias
Piwi Like RNA-Mediated Gene Silencing 1 HIWI CT80.1 PIWI Piwi-Like Protein 1 Piwi (Drosophila)-Like 1 Piwi-Like 1 (Drosophila) Piwi Homolog EC 3.1.26.- MIWI
Location (GRCh38)
12:130337887-130372637
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HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_004764.5
Sequence length
3897.0 nt
GC content
0.4332

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1141.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1214.94 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 984.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001190971.2 NCBI
GUUACUGGGCGUAUGGCGUACAGACACGAGGCCGGCGCCCGGGAGGCGG… 2801 nt 0.4684
NM_004764.5 NCBI
GUUACUGGGCGUAUGGCGUACAGACACGAGGCCGGCGCCCGGGAGGCGG… 3897 nt 0.4332
Summary

This gene encodes a member of the PIWI subfamily of Argonaute proteins, evolutionarily conserved proteins containing both PAZ and Piwi motifs that play important roles in stem cell self-renewal, RNA silencing, and translational regulation in diverse organisms. The encoded protein may play a role as an intrinsic regulator of the self-renewal capacity of germline and hematopoietic stem cells. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2010]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PIWIL1 is essential for spermatogenesis and repression of transposons in the male germline [Ross et al. DOI:10.1038/nature12987]. Research in golden hamsters showed that the PIWIL1 binds piRNAs in testis and ovary and is required for fertility, with its deficiency causing meiotic arrest of spermatogenesis and arrest at the 2-cell stage in embryogenesis [Xin Wang et al. DOI:10.1038/s41580-022-00528-0].