Basic Information

Symbol
PIWIL2
RNA class
mRNA
Alias
Piwi Like RNA-Mediated Gene Silencing 2 HILI CT80 Cancer/Testis Antigen 80 Mili Piwi-Like Protein 2 FLJ10351 Testicular Tissue Protein Li 141 Piwi-Like 2 (Drosophila) Piwil2-Like Protein Piwi-Like 2 EC 3.1.26.- Hiwi-Like PIWIL1L
Location (GRCh38)
8:22275316-22357568
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018068.5
Sequence length
5114.0 nt
GC content
0.4634

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1625.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1726.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1380.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001135721.3 NCBI
AUUCGAGGCCCGGCGCCGCGGCCCCAAGAAGGUGUCCAGGUUGGGGCGG… 5494 nt 0.4729
NM_001330480.2 NCBI
GUGGGCCCCGGGGCGUGGGUUGAGCUCGGUCUUCCCCUGAGGCCGCGCG… 5006 nt 0.4626
NM_018068.5 NCBI
GUGGGCCCCGGGGCGUGGGUUGAGCUCGGUCUUCCCCUGAGGCCGCGCG… 5114 nt 0.4634
Summary

PIWIL2 belongs to the Argonaute family of proteins, which function in development and maintenance of germline stem cells (Sasaki et al., 2003 [PubMed 12906857]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PIWIL2 is essential for spermatogenesis and repression of transposons in the male germline [Ross et al. DOI:10.1038/nature12987].