Basic Information

Symbol
PIWIL3
RNA class
mRNA
Alias
Piwi Like RNA-Mediated Gene Silencing 3 HIWI3 Piwi-Like Protein 3 Piwi-Like 3 (Drosophila) Piwi-Like 3
Location (GRCh38)
22:24719034-24774720
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001255975.1
Sequence length
3481.0 nt
GC content
0.4436

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-948.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1019.11 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1062.53
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001008496.3 NCBI
AUUUUGCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGUGCCCGCCA… 3508 nt 0.4433
NM_001255975.1 NCBI
AUUUUGCUGCCUCAGCCUCCCGAGUAGCUGGGACUACAGGUGCCCGCCA… 3481 nt 0.4436
Summary

This gene encodes a member of the PIWI subfamily of Argonaute family proteins. This subfamily of proteins contains a PAZ domain, found in proteins involved in RNA-mediated gene silencing, and a C-terminal Piwi domain. The encoded protein is thought to function in maintenance of germline cells. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Dec 2011]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PIWIL3 is essential for spermatogenesis and repression of transposons in the male germline [Ross et al. DOI:10.1038/nature12987]. Research in golden hamsters further showed that the PIWIL3 binds ~19 nt piRNAs with a 1U preference, localizes to the cytoplasm, and is required for female subfertility, causing a delay in early embryogenesis [Xin Wang et al. DOI:10.1038/s41580-022-00528-0].