Basic Information

Symbol
PKDCC
RNA class
mRNA
Alias
Protein Kinase Domain Containing, Cytoplasmic Vertebrate Lonesome Kinase SgK493 Vlk Protein Kinase Domain-Containing Protein, Cytoplasmic Extracellular Tyrosine-Protein Kinase PKDCC Protein Kinase-Like Protein SgK493 Sugen Kinase 493 Protein Kinase Domain Containing, Cytoplasmic Homolog (Mouse) Protein Kinase Domain Containing, Cytoplasmic Homolog EC 2.7.10.2 SGK493 RLSDF VLK
Location (GRCh38)
2:42048021-42058525
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138370.3
Sequence length
2490.0 nt
GC content
0.6442

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1223.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1263.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 545.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((..((((.((.((.((((((((...((((((((((((((((((((((((((...((.(((((((((((((((((((((..((((((.(.((((.((((.(((((...)))))(((((((((((((((.((((((.(((((.((...(((((((((((.(((((((((.((...((((.(((.((((.((....)).)))).)))..))))))))))))))).).((((..(((.....))).))))..((((((((((((((.(((((((..(((.(((((((((((((.((((((((((((((.......))))))..)))))))))).))))).)))))).))).....((((.(((((((......))..)))))....))))))))))).))))))))))))))))))))))))..))))))).)))..))).)))))))))))))))...)))))))))))))))))))))))))...)))))))))..)).))...).))))).))).)).))))))).))))))))..)).((((((.((((((((((((((.((((.(((..(((...)))..))))))))))))).........(((((((((((((((..((((((.....(((((((((.(((..(.((((((.....)))))))..))))))))))))..))))))......(((((((((.(((((.(.......).)))))...(((((((((.....)))))))))...))))))))).((.((((((((((((((((((((((((((((......))))))))))).....)))((((.(((..((((((.(.((....(((((.(.((.(((......))).)).))))))..)))))))............((((((((....((.(((((((..(((....))).(((((..((..(((..(((((((((((((.((.((...((.(((.....(((.(((((((((..(((...(.((((((...((((.....)))))))))).)...)))....)))))))))))))))))...)).)))))))))))...(((.((((((((((((((.........(((.((((...(((((((......(((..((((((.......)))))).)))(((.((((((....(((..(((((((((.((.......)).)))))................)))))))...)))))))))......(((((((......)))).)))(((((.((.((.((((.(....).)))).)).)).)))))...))))))).)))).)))..))))))))..))))))))).)))).)))..)).))))).)))).))).)))))))))).))..))).)))).....)))).)))))))))).)).((((((((((..((((((((((.(((...(((...(((((....)))))....)))........((((((.((((.(((((.((.....)).))).)))))).)).))))...((((((........))))))..)))..))))))))))))))))))))......(((......)))..((.((((((((((((.......(((....)))...((((((((((.......(((((((.((((((....))))))...)))))))...(((((((.(((((.((((...(((((.((((.((....)).)))).)))))((((((......((.......)).....))))))....(((((.((.(((..((((...(.(((....))))...)))).......(((((...(((((((....)))).)))..)))))((((((((((......(((((((....))))))).....))))((((((.......))))))))))))..(((((((..((((((((.((((.....)))(((....)))).))))))))..((((((.....))))))..........((...(((((((((((((((((..((....))..))))).))))))))))))))))))))).....((((.((((((((.(((((.(((.((((((.......)))))))))))))))))))))).))))..))).))))))).(((((((((((.......).))))))..)))).....))))))))).))))))).)))))))))).(((((....))))).((....))......)))))))))))).))))))))))))))))).)).)))))).))))))..))).))).))...)).))))))))))))......((((((((................))))))))..........((.((((......)))).))...........((((((...((((...(((((((..(((..(((........)))..)))..))))))).))))..)))))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
,((((((((..((((.((.({.(((((({{...((((((((((((((((((((((((((.,{((,({(((((((((((((((((({.(((((((.(.((((.((((.(((((...)))))(((((((((((((((.((((((.(((((.((...(((((((((((((({({(,,(((.({((,(({,(({(((({,({....|{||||{|,,..))))))),))),)))}))||||}.|||}}}}.,),},)))}.((((((((((((((.(((((((..(((.(((((((((((((.((((((((((((((,{....}))))))..)))))))))).))))},)))))).))).....((((.((((({(......))}.}))))....))))))))))).))))))))))))))))))))))))..))))))).)))..))).))))))))))))))),..))))))))}))))))))))))))))...))))))))).,)).)).,,).))))).))).)))))))))).))))))))..||.((((((.((((((((((((((,((((.(((..(((...)))..)))))))))))))|........(((((((((((((((..((((((.....(((((((((.(((..(.((((((,...,)))))))..))))))))))))..))))))......(((((((((.(((((.(.......).)))))...(((((((((.....))))))))).,.))))))))).((.(((((((((((((({{.(((((((((((......))))))))))),,..,{{,((({,(((..((((((.(.((....(((((.(.((.(((......))).)).)))))).,)))))))............((((((((....,{,({(((((,.(({....}||.|((((|{(,.{({,({((({(((((((({,((.{({{,((.{{{....,|||,(((((((((.{(,,,{.({((({((.{{((((.....)))))),)),.}}}}))),}}.)))))))))}}}}}},}..,)}.))))))))))).,,||(.((((((((((((((.........(((.((((...(((((((.....,{{(..((((((,...,..}))))).)),|{(.(((({{,...{,((((.(((((((.{,.......}}.))))))}.)))}.........,||,,,,.,,)}))})))}......{((((((......)))).))}(((((.((.((.((((.{....}.)))).)).)).)))))...))))))).)))).)))..)))))))}.,))))))))).})))|)})..}).)}.}}.)))).,)).,,)))))))).})..))}.)))}),...)))).))))))))))})}.{(((((({{{,,((((((((((.(((...{,,...{|{((,.,,|}|}}.,,,|}}........((((((.((((.(((((.((.....)).))).)))))).)))))))...((((((........)))))).,)))..))))))))))))))}}))},....|||||.,,...))},}|(.((((((((((((.......,,,...,|||...(((((((.(((((((..(((((((.((((((....))))))...)))))))...(((((((.(((((.(((({{.((((({((({{(((..{{{{((,,(((|.,{(((((......((.......)).....))))))}}}..))).}))..)))){,{{,{{{{(({....))),..,)))}....,}}}}||||,}|((((((,,..||||.}|{{{,{{|,.{{|{{((|{......(((((((....))))))).....}}},})))))),.))).,})||{{|.{{{{{((((((,..((((((({.{{{|..,..}||{{|..}})}})})}}}}))),,((((((.....))))))..........{{...(((((((((((((((((..((....))..)))))}})))))))))))}}|}))|||,..,{((((.(((((((,{(((((.(({,((((((.......)))))))))))))))))))))).)))).}|||,..}}}.)})|})))))))))}.,.)))},,||||..,,}))},,.))))))))).)))))))))))))),}.))))))}.,.,}}|||.{{.,,,),......)))))))))))).),))))))))))))))).)).)))))).))))))..))))})),))...)).))))))))))))}.....((((((((................))))))))..........{,{(((({,,,,,||||..,.,,}}......(((((((((((.{{{(((((((({...,}}})))))}}}},.))}})))))}}..,}},}},}}},))),,.

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_138370.3 NCBI
AGGCAAGUGUCAGGCCGAUGUGUCGCCCGCGAGGGGCCGGGGUCGGGGC… 2490 nt 0.6442
Summary

Enables non-membrane spanning protein tyrosine kinase activity. Involved in peptidyl-tyrosine phosphorylation and skeletal system development. Located in extracellular region. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.