Basic Information

Symbol
PKIB
RNA class
mRNA
Alias
CAMP-Dependent Protein Kinase Inhibitor Beta PRKACN2 Protein Kinase (CAMP-Dependent, Catalytic) Inhibitor Beta PKI-Beta CAMP-Dependent Protein Kinase Inhibitor 2
Location (GRCh38)
6:122471917-122726375
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_181795.3
Sequence length
1706.0 nt
GC content
0.3628

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-416.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -451.49 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 477.65
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001270393.2 NCBI
GCGCAUGCGCGUCACUAGACGACACGGCUGUCUUCUUUCCUGGAGAAUU… 1992 nt 0.3594
NM_001270394.2 NCBI
GCGCAUGCGCGUCACUAGACGACACGGCUGUCUUCUUUCCUGGAGAAUU… 1933 nt 0.3482
NM_001270395.2 NCBI
AAUUAUCCGCACAGGCUCUAGAACUUGGUUUCUUGAAGAAGUUGUAGGA… 1598 nt 0.3335
NM_032471.6 NCBI
AGACGCGGCCGCAUCCCGGUGGACUGUAGAGGCGGCAGCGAGCUAGAGC… 1639 nt 0.3679
NM_181794.3 NCBI
GCGCAUGCGCGUCACUAGACGACACGGCUGUCUUCUUUCCUGGAGAAUU… 1872 nt 0.3419
NM_181795.3 NCBI
AGACGCGGCCGCAUCCCGGUGGACUGUAGAGGCGGCAGCGAGCUAGAGC… 1706 nt 0.3628
Summary

This gene encodes a member of the cAMP-dependent protein kinase inhibitor family. The encoded protein may play a role in the protein kinase A (PKA) pathway by interacting with the catalytic subunit of PKA, and overexpression of this gene may play a role in prostate cancer. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.