Basic Information

Symbol
PLA2G2D
RNA class
mRNA
Alias
Phospholipase A2 Group IID SPLA2S Secretory-Type PLA, Stroma-Associated Homolog Phosphatidylcholine 2-Acylhydrolase 2D Group IID Secretory Phospholipase A2 GIID SPLA2 SPLA2-IID PLA2IID SPLASH Phospholipase A2, Group IID Secretory Phospholipase A2s EC 3.1.1.4
Location (GRCh38)
1:20111939-20119566
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_012400.4
Sequence length
2651.0 nt
GC content
0.5443

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-986.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1030.50 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 575.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001271814.2 NCBI
ACUGCCAGCAUCUGCCUCCACUGCUCUGUGCUGGGAUCAUGGAACUUGC… 2544 nt 0.5452
NM_012400.4 NCBI
ACUGCCAGCAUCUGCCUCCACUGCUCUGUGCUGGGAUCAUGGAACUUGC… 2651 nt 0.5443
Summary

This gene encodes a secreted member of the phospholipase A2 family, and is found in a cluster of related family members on chromosome 1. Phospholipase A2 family members hydrolyze the sn-2 fatty acid ester bond of glycerophospholipids to produce lysophospholipids and free fatty acid. This gene may be involved in inflammation and immune response, and in weight loss associated with chronic obstructive pulmonary disease. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Nov 2012]

Forensic Context

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