Basic Information

Symbol
PLAC8
RNA class
mRNA
Alias
Placenta Associated 8 Onzin C15 Placenta-Specific Gene 8 Protein Placenta Specific 8 Down-Regulated In Gastrointestinal Cancer Protein Protein C15 PNAS-144 DGIC
Location (GRCh38)
4:83059493-83137075
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_016619.3
Sequence length
1374.0 nt
GC content
0.4374

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-400.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -425.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 363.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130715.2 NCBI
AUUUGUGGUGAGAUUCUCUCCCAGGCCACAAGACAUUUCCUGCUCGGAA… 2267 nt 0.4089
NM_001130716.2 NCBI
AAGAAUUUACCGGCAGGCAGGUCUGGUCCCAGCAGAGGAGACCCAGGGG… 1472 nt 0.4633
NM_016619.3 NCBI
AUUUGUGGUGAGAUUCUCUCCCAGGCCACAAGACAUUUCCUGCUCGGAA… 1374 nt 0.4374
Summary

Predicted to enable chromatin binding activity. Predicted to be involved in positive regulation of cold-induced thermogenesis and positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Predicted to act upstream of or within several processes, including brown fat cell differentiation; defense response to bacterium; and response to cold. Predicted to be located in azurophil granule lumen and extracellular region. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PLAC8 was previously identified with strong classification performance for sepsis and was validated in human cohorts, where its combination with CLU achieved high classification accuracy for distinguishing septic patients from healthy individuals [Zhang et al. DOI:10.1093/jimmun/vkaf140]. In human diagnostic model development, the PLAC8 was mentioned as an existing biomarker developed from microarray data and used for performance comparison against a novel deep learning framework [Zheng et al. DOI:10.1371/journal.pcbi.1012083].