Basic Information

Symbol
PLAC9
RNA class
mRNA
Alias
Placenta Associated 9 Placenta-Specific Protein 9 Placenta Specific 9
Location (GRCh38)
10:80131682-80145359
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001012973.3
Sequence length
776.0 nt
GC content
0.5876

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-306.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -320.08 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 143.92
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((((.(.((..((((((.((((((.(.(((((........))))).).)).)))).))))))..)).).)))))))(((((((.(((.(((((((....((((((((.((((....)))).....(((((((((((((((((((.....))))).)))))))...((((((((((.(((..((((..(..(((...((((.....((....(((((((....((((...(((((.(((...((....))...))).)))))...))))..))))))).)))))).))))..)))).)))..)))...))))))).)))))))......(((((...))))).))))))))((((......))))))))))).))).)))....)))).(((((((.(.(((....(((..(((.(((.(((....((.(((((((.((((((((((((((.((((.....)))).............(((((.(((....(((((((.((..(((((((((.............))))))))).......(((((....)))))..(((((.....))))))).)).))))).))))))))....))))))).)))))))....))))))).)).....)))..))).)))...)))....)))).)))))))..(((((....)))))...((((.((.......))..))))....(((((.((((((....((((.......))))......).)))))))))).)))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((((.(.((..((((((.((((((.(.(((((........))))).).)).)))).))))))..)).).))))))){(({(((.(((.(((((((....((((((((.((((....))))..,,,(((((((((((((((((((.....))))),}))))))...((((((((((.(((..((((,.{.,(((...({{{...,,{{.,,.(((((((.{,.((((...(((((.(((...((....))...))).)))))...))))}.))))))),}))))).}}}}..)))).)))..)))...))))))).)))))))..}}}.(((((...))))).))))))))((((......))))))))))).))).))).,,.}|||{(((((((.(.(((..,,(((,,(((.(((.(((....,(,(((((((.((((((((((((((,(({{..,,,}}},.............(((((.(((....((((({{,{...(((((((((.............)))))))))...,...(((((....)))))(((((((.....))))))).}).))))).))))))))....))))))).)))))))....))))))).))...,.)))..))).)))...))).},.)))).)))))),}}(((((....}}}}}...((((,{,,,,,,......,}}|,...{({(((((((((...}||,|}}}}}.,)}}||},,,,,,)))))),,},.))},.......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001012973.3 NCBI
AGACGCGGCGCUGCGCUCGGCCAGGCCGGCACCAUGCGGCCCCUGCUCU… 776 nt 0.5876
NM_001331125.2 NCBI
AGACGCGGCGCUGCGCUCGGCCAGGCCGGCACCAUGCGGCCCCUGCUCU… 655 nt 0.5740
Summary

Predicted to be located in extracellular region. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that a 38-gene transcriptomic signature, which includes the PLAC9, strongly correlates with body mass index and fat mass in subcutaneous adipose tissue, with changes in this signature also correlating with changes in BMI and fat mass within monozygotic twin pairs [Francesc Font-Clos et al. DOI:10.1088/1361-6579/aab85a].