Basic Information

Symbol
PLAT
RNA class
mRNA
Alias
Plasminogen Activator, Tissue Type Tissue-Type Plasminogen Activator T-Plasminogen Activator EC 3.4.21.68 Alteplase Reteplase T-PA TPA Plasminogen Activator, Tissue Plasminogen/Activator Kringle EC 3.4.21
Location (GRCh38)
8:42174718-42207709
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000930.5
Sequence length
3062.0 nt
GC content
0.5229

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1062.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1122.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 840.31
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000930.5 NCBI
AGAGCUGAGAUCCUACAGGAGUCCAGGGCUGGAGAGAAAACCUCUGCGA… 3062 nt 0.5229
NM_001319189.2 NCBI
AGAGCUGAGAUCCUACAGGAGUCCAGGGCUGGAGAGAAAACCUCUGCGA… 2795 nt 0.5131
NM_033011.4 NCBI
AGAGCUGAGAUCCUACAGGAGUCCAGGGCUGGAGAGAAAACCUCUGCGA… 2924 nt 0.5233
Summary

This gene encodes tissue-type plasminogen activator, a secreted serine protease that converts the proenzyme plasminogen to plasmin, a fibrinolytic enzyme. The encoded preproprotein is proteolytically processed by plasmin or trypsin to generate heavy and light chains. These chains associate via disulfide linkages to form the heterodimeric enzyme. This enzyme plays a role in cell migration and tissue remodeling. Increased enzymatic activity causes hyperfibrinolysis, which manifests as excessive bleeding, while decreased activity leads to hypofibrinolysis, which can result in thrombosis or embolism. Alternative splicing of this gene results in multiple transcript variants, at least one of which encodes an isoform that is proteolytically processed. [provided by RefSeq, Jan 2016]

Forensic Context

A study in porcine skin demonstrated that bromine exposure significantly increased the PLAT transcript in the 45 s–7 d and 8 min–7 d post-exposure groups, identifying it as part of the coagulation system signaling pathway [Price et al. DOI:10.1016/j.toxlet.2008.08.007]. A study in mice demonstrated that the PLAT mRNA expression in bruises is time-dependent, peaking at 1 hour post-injury with a slight secondary increase at 72 hours, and its detection in specific cell types like neutrophils and macrophages provides a correlation with histologic wound healing stages useful for wound age estimation [Takamiya et al. DOI:10.1007/s00414-004-0453-4].