Basic Information

Symbol
PLCB1
RNA class
mRNA
Alias
Phospholipase C Beta 1 PLC-I KIAA0581 PLC154 1-Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Phosphodiesterase Beta-1 Phospholipase C, Beta 1 (Phosphoinositide-Specific) Phosphoinositide Phospholipase C Phospholipase C-I EC 3.1.4.11 PLC-Beta-1 PLC-154 1-Phosphatidyl-D-Myo-Inositol-4,5-Bisphosphate Monophosphatidylinositol Phosphodiesterase Phosphoinositide Phospholipase C-Beta-1 Triphosphoinositide Phosphodiesterase Inositoltrisphosphohydrolase Phospholipase C-Beta-1 Phosphoinositidase C EIEE12 PI-PLC PLCB1A PLCB1B DEE12
Location (GRCh38)
20:8077251-8968360
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015192.4
Sequence length
7088.0 nt
GC content
0.4072

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1885.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2022.36 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2161.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015192.4 NCBI
ACUCGCUCUCUCCCUCUGUGUAUAGAGGAUGUGCUGAAUGGUGCGCUUU… 7088 nt 0.4072
NM_182734.3 NCBI
ACUCGCUCUCUCCCUCUGUGUAUAGAGGAUGUGCUGAAUGGUGCGCUUU… 7206 nt 0.4098
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the formation of inositol 1,4,5-trisphosphate and diacylglycerol from phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. This reaction uses calcium as a cofactor and plays an important role in the intracellular transduction of many extracellular signals. This gene is activated by two G-protein alpha subunits, alpha-q and alpha-11. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in humans found that the SNP rs1047383 in the PLCB1 gene was associated with drug abuse, as mentioned in the introductory discussion of the literature [Sun et al. DOI:10.1016/j.neulet.2019.134725].