Basic Information

Symbol
PLCG1
RNA class
mRNA
Alias
Phospholipase C Gamma 1 PLC-II PLCgamma1 PLC148 NCKAP3 PLC1 1-Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Phosphodiesterase Gamma-1 Phospholipase C, Gamma 1 (Formerly Subtype 148) Phosphoinositide Phospholipase C-Gamma-1 Phospholipase C-II PLC-Gamma-1 EC 3.1.4.11 PLC-148 1-Phosphatidyl-D-Myo-Inositol-4,5-Bisphosphate Monophosphatidylinositol Phosphodiesterase Triphosphoinositide Phosphodiesterase Phosphatidylinositol Phospholipase C Phosphoinositide Phospholipase C Inositoltrisphosphohydrolase Phospholipase C, Gamma 1 Phospholipase C-Gamma-1 Phosphoinositidase C Phospholipase C-148 IDAA
Location (GRCh38)
20:41136931-41196801
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002660.3
Sequence length
7092.0 nt
GC content
0.5413

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2630.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2761.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1941.91
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002660.3 NCBI
GUCUGCCGCCUCAGCCUCAGCCCCAACCUCAGCCGCCGCCGUUGCGCUU… 7092 nt 0.5413
NM_182811.2 NCBI
GUCUGCCGCCUCAGCCUCAGCCCCAACCUCAGCCGCCGCCGUUGCGCUU… 7089 nt 0.5413
Summary

The protein encoded by this gene catalyzes the formation of inositol 1,4,5-trisphosphate and diacylglycerol from phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate. This reaction uses calcium as a cofactor and plays an important role in the intracellular transduction of receptor-mediated tyrosine kinase activators. For example, when activated by SRC, the encoded protein causes the Ras guanine nucleotide exchange factor RasGRP1 to translocate to the Golgi, where it activates Ras. Also, this protein has been shown to be a major substrate for heparin-binding growth factor 1 (acidic fibroblast growth factor)-activated tyrosine kinase. Two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008] CIViC Summary for PLCG1 Gene

Forensic Context

A study in pediatric septic shock patients identified two subclasses based on whole blood RNA expression profiles, where Subclass 1 was characterized by upregulated innate immunity and downregulated adaptive immunity pathways, leading to worse clinical outcomes [Yang et al. DOI:10.1186/s13054-023-04689-y].