Basic Information

Symbol
PLD1
RNA class
mRNA
Alias
Phospholipase D1 Choline Phosphatase 1 Phosphatidylcholine-Hydrolyzing Phospholipase D1 Phospholipase D1, Phosphatidylcholine-Specific EC 3.1.4.4 CVDP1 PLD 1 HPLD1 CVDD
Location (GRCh38)
3:171600404-171810950
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002662.5
Sequence length
6015.0 nt
GC content
0.4185

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1629.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1750.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1331.08
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001130081.3 NCBI
GCUGAGCUCCAGCUGUGCCAGAGGCACCCGAGCCCUGAGAGUCCGCCGC… 5901 nt 0.4187
NM_002662.5 NCBI
GCUGAGCUCCAGCUGUGCCAGAGGCACCCGAGCCCUGAGAGUCCGCCGC… 6015 nt 0.4185
Summary

This gene encodes a phosphatidylcholine-specific phospholipase which catalyzes the hydrolysis of phosphatidylcholine in order to yield phosphatidic acid and choline. The enzyme may play a role in signal transduction and subcellular trafficking. Alternative splicing results in multiple transcript variants with both catalytic and regulatory properties. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in rats demonstrated that the mRNA Pld1, identified as a hub gene within a protein-protein interaction network from a ceRNA analysis, was upregulated in the cavernosum of a bilateral cavernous nerve crush model of erectile dysfunction and was suggested to be regulated by the miRNAs rno-let-7a-2-3p and rno-miR-129-2-3p [Huang et al. DOI:10.1080/21655979.2021.1973863].