Basic Information

Symbol
PLD4
RNA class
mRNA
Alias
Phospholipase D Family Member 4 C14orf175 (S,S)-Bis(Monoacylglycero)Phosphate Synthase PLD4 5'-3' Exonuclease PLD4 Phospholipase D4 Phosphatidylcholine-Hydrolyzing Phospholipase D4 Chromosome 14 Open Reading Frame 175 Phospholipase D Family, Member 4 Choline Phosphatase 4 EC 3.1.16.1 EC 3.1.4.- EC 3.1.4.4 PLD 4
Location (GRCh38)
14:104924713-104937761
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138790.5
Sequence length
1905.0 nt
GC content
0.6546

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-873.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -906.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 401.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001308174.2 NCBI
AGAGAAGAGGAGGUUGGUGUGGAGCACAGGCAGCACCGAGCCUGCCCCG… 6492 nt 0.6075
NM_138790.5 NCBI
AGAGAAGAGGAGGUUGGUGUGGAGCACAGGCAGCACCGAGCCUGCCCCG… 1905 nt 0.6546
Summary

Predicted to enable single-stranded DNA 5'-3' DNA exonuclease activity. Predicted to be involved in hematopoietic progenitor cell differentiation; phagocytosis; and regulation of cytokine production involved in inflammatory response. Predicted to act upstream of or within establishment of localization in cell. Predicted to be located in early endosome and endoplasmic reticulum membrane. Predicted to be active in several cellular components, including endoplasmic reticulum; phagocytic vesicle; and trans-Golgi network membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified the PLD4 as a differentially expressed mRNA downregulated in the peripheral whole blood of sepsis patients compared to healthy controls [Qin et al. DOI:10.1097/JCMA.0000000000000209].