Basic Information

Symbol
PLEKHG1
RNA class
mRNA
Alias
Pleckstrin Homology And RhoGEF Domain Containing G1 KIAA1209 ARHGEF41 Pleckstrin Homology Domain Containing, Family G (With RhoGef Domain) Member 1 Pleckstrin Homology Domain-Containing Family G Member 1
Location (GRCh38)
6:150599848-150843665
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001029884.3
Sequence length
7217.0 nt
GC content
0.4543

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2112.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2250.91 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2291.87
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001029884.3 NCBI
GAGCCUGAGCCCGAGCCCGAGCCCGACGGCGGCUGCAGGGCGCUCCGGC… 7217 nt 0.4543
NM_001329798.2 NCBI
AUAACUGGCAAACUAAGGAUGACAGAGUGUUCAAUGAUGCUGUUCAACU… 7220 nt 0.4499
NM_001329799.2 NCBI
GAGCCUGAGCCCGAGCCCGAGCCCGACGGCGGCUGCAGGGCGCUCCGGC… 7158 nt 0.4550
NM_001329800.2 NCBI
AUAACUGGCAAACUAAGGAUGACAGAGUGUUCAAUGAUGCUGUUCAACU… 7261 nt 0.4502
NM_001329801.2 NCBI
GGAAGGCGCUGCACAGACUAGCAAAGGCUGUUUCUUUUACCUGACUGAG… 7127 nt 0.4493
NM_001329802.2 NCBI
GGAAGGCGCUGCACAGACUAGCAAAGGCUGUUUCUUUUACCUGACUGAG… 7088 nt 0.4494
NM_001329803.2 NCBI
GGAAGGCGCUGCACAGACUAGCAAAGGCUGUUUCUUUUACCUGACUGAG… 7010 nt 0.4501
NM_001329804.2 NCBI
GAGCCUGAGCCCGAGCCCGAGCCCGACGGCGGCUGCAGGGCGCUCCGGC… 4583 nt 0.4355
NM_001329805.2 NCBI
GAGCCUGAGCCCGAGCCCGAGCCCGACGGCGGCUGCAGGGCGCUCCGGC… 4537 nt 0.4355
NM_001329806.2 NCBI
GGAAGGCGCUGCACAGACUAGCAAAGGCUGUUUCUUUUACCUGACUGAG… 4447 nt 0.4270
Summary

Predicted to enable guanyl-nucleotide exchange factor activity and small GTPase binding activity. Predicted to be involved in regulation of small GTPase mediated signal transduction. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the PLEKHG1 as a shared upregulated differentially expressed gene in left ventricular tissue from animals with spontaneously occurring hypertrophic cardiomyopathy compared to adult human HCM cases [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].