Basic Information
Symbol
PLG
RNA class
mRNA
Alias
Plasminogen
EC 3.4.21.7
EC 3.4.21
Plasmin
HAE4
Location (GRCh38)
6:160702105-160754097
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_000301.5
Sequence length
3530.0 nt
GC content
0.4790
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1087.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-1154.25 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
920.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GUAAGUCAACAACAUCCUGGGAUUGGGACCCACUUUCUGGGCACUGCUG… | 3530 nt | 0.4790 | |
| GAAUCAUUAACUUAAUUUGACUAUCUGGUUUGUGGAUGCGUUUACUCUC… | 1200 nt | 0.3767 |
Summary
The plasminogen protein encoded by this gene is a serine protease that circulates in blood plasma as an inactive zymogen and is converted to the active protease, plasmin, by several plasminogen activators such as tissue plasminogen activator (tPA), urokinase plasminogen activator (uPA), kallikrein, and factor XII (Hageman factor). The conversion of plasminogen to plasmin involves the cleavage of the peptide bond between Arg-561 and Val-562. Plasmin cleavage also releases the angiostatin protein which inhibits angiogenesis. Plasmin degrades many blood plasma proteins, including fibrin-containing blood clots. As a serine protease, plasmin cleaves many products in addition to fibrin such as fibronectin, thrombospondin, laminin, and von Willebrand factor. Plasmin is inactivated by proteins such as alpha-2-macroglobulin and alpha-2-antiplasmin in addition to inhibitors of the various plasminogen activators. Plasminogen also interacts with plasminogen receptors which results in the retention of plasmin on cell surfaces and in plasmin-induced cell signaling. The localization of plasminogen on cell surfaces plays a role in the degradation of extracellular matrices, cell migration, inflamation, wound healing, oncogenesis, metastasis, myogenesis, muscle regeneration, neurite outgrowth, and fibrinolysis. This protein may also play a role in acute respiratory distress syndrome (ARDS) which, in part, is caused by enhanced clot formation and the suppression of fibrinolysis. Compared to other mammals, the cluster of plasminogen-like genes to which this gene belongs has been rearranged in catarrhine primates. [provided by RefSeq, May 2020]
Forensic Context
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