Basic Information

Symbol
PLIN1
RNA class
mRNA
Alias
Perilipin 1 PLIN Lipid Droplet-Associated Protein Perilipin-1 PERI Perilipin FPLD4
Location (GRCh38)
15:89664365-89679450
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Tissue/body fluid identification Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002666.5
Sequence length
2916.0 nt
GC content
0.5590

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1117.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1168.19 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 554.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001145311.2 NCBI
ACUCUGCAGCCUGGGCUCUGUGAGACUGAGGUGGCGGUCAGCCGGACUU… 2845 nt 0.5610
NM_002666.5 NCBI
ACUCUGCAGCCUGGGCUCUGUGAGACUGAGGUGGCGGUCAGCCGGAGUG… 2916 nt 0.5590
Summary

The protein encoded by this gene coats lipid storage droplets in adipocytes, thereby protecting them until they can be broken down by hormone-sensitive lipase. The encoded protein is the major cAMP-dependent protein kinase substrate in adipocytes and, when unphosphorylated, may play a role in the inhibition of lipolysis. Alternatively spliced transcript variants varying in the 5' UTR, but encoding the same protein, have been found for this gene. [provided by RefSeq, Feb 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the PLIN1 is expressed in adipose tissue with an average read count of 21,176 and was used as part of a 46-plex targeted mRNA panel for definitive organ tissue identification, showing high specificity and successful validation in a single-blind study [Hanson & Ballantyne DOI:10.3390/genes8110319]. Research in mice showed that the PLIN1 serves as an adipocyte marker, with an increased number of PLIN1-positive cells observed in the myocardium of a genetic model of arrhythmogenic cardiomyopathy, correlating with pathological adipogenesis [Yuan et al. DOI:10.1161/CIRCULATIONAHA.120.052928].