Basic Information

Symbol
ASPRV1
RNA class
mRNA
Alias
Aspartic Peptidase Retroviral Like 1 SASPase Taps Skin-Specific Retroviral-Like Aspartic Protease TPA-Inducible Aspartic Proteinase-Like Protein Retroviral-Like Aspartic Protease 1 Skin ASpartic Protease FLJ25084 SASP Skin Aspartic Protease EC 3.4.23.- ADLI MUNO TAPS
Location (GRCh38)
2:69960089-69961631
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_152792.4
Sequence length
1543.0 nt
GC content
0.5580

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-625.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -653.12 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 322.90
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_152792.4 NCBI
ACAGCACUGCCUGCCUCUGCCCCAGCAGUCAGCCAGCCGACCGCGCCUG… 1543 nt 0.5580
Summary

Filaggrin is a structural protein that is crucial for in the development and maintenance of the skin barrier. This gene encodes a retroviral-like protease involved in profilaggrin-to-filaggrin processing. Expression is found primarily in the epidermis and inner root sheath of hair follicles. [provided by RefSeq, May 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.