Basic Information

Symbol
PLIN4
RNA class
mRNA
Alias
Perilipin 4 KIAA1881 S3-12 Adipocyte Protein S3-12 Perilipin-4 Muscular Dystrophy, With Rimmed Vacuoles MRUPAV NIPA2 MDRV
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Postmortem interval inference

MANE select

Transcript ID
NM_001367868.2
Sequence length
6502.0 nt
GC content
0.6241

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2959.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3049.76 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1250.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((.(((...(((((((((((.((((..(.((((((((((((.((..........(((((((((((((.((.((.((((.((((.((((...))))((((((((((.(((((......(((((((((........(((....(((.....)))........(((((.......((((.((((((..(((((...(((.((((...(((((..((((...((((((.......))).))).))))..)))))..)))))))....)))))...))))))))))(((((((((.(((........))).))).))))))))))).))).))))))))).......)))))..).))))))))).))))(((((..(.(((((((((..((((...(((((((......)).))..)))...))))..))))))))).)..)))))))))..)).)).)))))))))))))....((((((((((((....))))))..)))))))).))))......((((((((......)))))))).)))))))).).))))..)))))).)))))..(((((((((((..((((((..((((((((...))).)))))..)))..).))..))))..((((((((((.((((.((((((.((.......)).)).......))))...)))).).)))))))))......((((((((............)).)))))).....(((((((((.((.(((((((.(((.((((...(((((((..((((((((((((((....))).(((((((((((..(((((.......)))))(((((.(((......)))))))).(((((((..((...))..)))))))..(((((((((...(((((.((((((((((....((((((.((((((..((((.((.((((((..((...(((((....)))))...))..))).((((..((((..((((..(((.((((((((((((...........))))))..)))).)).)))(((..((...(((((....)))))...))..))).))))..))))..))))..))).))))))))))))....)))))).))))))..))))((((((.(((..((...(((((....)))))...))..))).(((((.(((.(.(((((.((((..((((((((((...((((((((....((((.(((((((.(.((((.((.(((((((((...(((((.....)))))((((((....))))))((((((((......))))....)))).........((.(((((.(((......)))))))).))...((((((.....))))))......((((.((....)).)))).....))))....)))))...)).)))).))))))).).))))..))))))))........(((((.(((((.(((.......(.((((...)))))..))).)))))..)))))....))))))..))))...))))((((.((...(((((....)))))....))))))))))).).))).)))))))))))..((((......))))(((((..........))))).)))))((....(((((((((..((((((.((..((..((((((...(((((((((.((((.(((((((((((((...........))))))..))))....))))))).(((((((((((...(((((..(((((((.(((((((....)))))))(((((.......)))))...............(((((((.(((..((((((((((((((.........((((..((((((((...((((.(((((.....(((((......).))))....)))))..((((.((((....))))(((((.(((.((((.....)))).)))..))).))))))...(((((..(((((..........)))))....((((((....(((.((((.....)))).)))....)))))).(((((.((((..((((((((((.....((((.((....)).))))......)))..((((..(((((.....)))))(((((.(((((((((((.(((.(((.((((((.....))).((((((...(((.(((.(((((......)))))))))))((.((((..(((((((((.((..((((((((((((.(((((....((.((((..(((((((((((........))))))((((..((((((((((...........))))))..))))...))))((((.((((.(((.(....((((((.....)))))).....).))))))).)))).........)))))...)))))).......))))).)))).))))))))..))(((((......)))))...((...((((((........))))))...))..)))))))))...)))).))..(((((((((((.......(((..(((((.(.((......((((.....))))((((.(((.(((.(((.(((((......))))))))))).)).)...))))(((((((...((((((.((((((((((.((......((((((((((((((((....((((.((....)).)))).......)).))))..........))))))))))..)).))).)))))))))((....))((((.....))))(((((((....))))))).......((((......))))((((.......))))..(((((((.(((((((.((..((......(((((((.....(((((((..(((((((.(((((..........))))))).)))))..........((((((.((((..((((((((...((......(((.(((..((.((((((.......(((....)))......)))))).))...))))))...))...)))))))))))).))..))))))))))).....))))))).))..))))).)).)).).))))))(((((...((((((((((((((.((((.....(((((....)))))((....))))))))))))))))))))...))))).(((((((....))))))).))))..))))))))).)))))).)))....))))))))))).))))))...(((((((((.....(((((.......))))).....))))))))).))).)))))).))))))))))).....((((((((..(((((((((((.....))).))))))))..........)))))))).....))))))))))))))))....)))).)))))...(((((.(((........))).)))))((.((((((((.(.(((.((((.((((((((((((((.((......((((((..(..((((((....))).)))..)..))))))(.(((((((.((((((.((.(((((((((((((.........))))....)))))))))..(((.(((..((((.(....((.(((.(.((((.((((((....)))))))))).).))).))..).)))).))).)))....)))))))).))))))).)..(((((((((.(((((((...((((.(((..((..((.....)).))..))).))))...))))))).)).)))))))((((.(.(((((..((.((((.(((..((((((((((......)))))....)))))..))).)))).(((((...((((.........)))).)))))(((((....(((((((..(((((...(((.(((......)))..)).)..)))))..)))))))....)))))))..))))).))))).....)))).)))))).)))))).))))))).)....)))))))).))))))))))).))))))))..))))((((((((..((((((........)))))).)))).))))..))))))))))))))..))))))))))((((..(((((((((.((.((..(((((((((..(((((((((((((.(.((....)).).))))))))((..((((((((((..(.((((((((((.(((...............)))..))))).))))).)..))))))).)))..))))))).)))))))))..)).)))))))).((((((((((.(((((((......((((.((..(((((((.(((((((((((....)))..(((...(((....)))..)))........((((((((....))))))))(((((((((.....)))....)))))).))))))))..))))))).)).))))........))))))).)))))))))).(((((((((((((((((.(((((((((((((((((((((.((...((((((((.....)))).)))))).)))).((((....)))).......((..(..((((((((.((((.((....((((((.((((((.........))))))))))))((((.(((((..............))))).)))))))))))))..)))))..)..)).....(((...))))).))))))))))))).)).......((((((.(((((((..((((((((..(((....((.(((((((..((((((.........((((((................))))))(((((.....)))))......(((....)))............(((((((.......)))))))))))))...)))))).).)))))..))))))))..))))))).)))))).(((((((((..(((((.((...)).))))).)))))...).))).(((...)))))))))))))))))))).......)))....)))).(((((.(((.(((((((((.......)))..(((((((....)))))))(((((((((((((((((((((((((..(((.(((....(((.......)))........(((((((((......(((..((((....))))..)))...((((((((..(((((((.((((..(((((((...))))).))....)))).(((((((((((..((((((.((((.((((...((..((((((((((((.((((..((((((((((((.((((((.(.((((((.....)))))).).)))).))...)).)).))))))))..))))..)).))))).)).))))).)))).).)))))))))..)))))))...)).)).)))))))..)))))))).)))))))))))).)))..))))))))))))))))..((((..(((((.(((((..(((......)))....(.((((((((((......((((.((........)))))).((((.......))))..))))))).))).)((((((..((..(((...)))..)).)))))))))))((..((((((..........))))))..)))))))...))))..((((.....))))...((((.(((((.(.(((((((...(((..((....)).)))...)))))))..).))))).))))...)))).)))))((((.(((((..((...(((.(((((((.........))).)))).)))...))..))))))))).....))).)))))).))))).......)))))))...)))))..)))))).........)))))..(.(((....))).))))))))))...))))........((((.((((.(((((...((((....))))...))))))))).))))...))..)).)).)))))).)))))))))...))...((((((..(((...((.((((((((..((((..((((....(.((((((...)))))).)...))))...(((((((.(.(((((...((((((((((..((((..((((.((.(((...))).))))))..))))..))).)))))))..))))).).)).)))))))))..))))..)))).))...))).))))))))))))))).(((((.(.(((((((.((((((((((((...(((((.....)))))........))))).)).)))).).)))))))).))))))))))))))))..)))))..))))))...(((((.((....)).)))))...((((..(((((((((....(((.(((......)))))).)))))))))...))))(((.((..((((((......))))))..)).)))......))))))).....)))).)))..))))))).)))).)))))))....))))))).)))...))))...(((.(.....).))).......(((((.........)))))......
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((.(((...(((((((((((.((((..{.((((((((,{{,.((.{{{{..{{{((({{,,{{{|||}||.|,.||||.||(({(({,{{((({(((((((((((.(((((......(((((((((..,.....(({....(((....}}}|.......,(((,....}}}|((((,((((((.{(((((...(((.((((...(((((,,((((...{(((((.....,)),),}}}.)))),.)))))..))))))).}..))))),}.))))))}))}(((((((((.(((........))).))).)))))),}))).,}..))))))))).......)))))..),,))))))))}{|({{((((..(.(((((((((..((((...((({(((......))}.}..)))...))))..))))))))).)..)))))))}|{{||.||{,,,,,))))))))....((((((((((((....)))))}.,))))))))})))}.}}}}}((((((((......)))))))).)))))))).).))))..)))))).)))))..(((((((((((..(({(((..((((((((...))).)))))..)))..}.))..))))..((((((((((.((((.(((({(.({.......)).)).......))))...)))).).)))))))))......((((((((............)).)))))),,...((((((({{.((.(((((((.,{{.((((,.{(((((,,.((((...((((((((....))).(((((((((((..(((((.....,.)))))(((((.(((......)))))))).(((((((..((...))..)))))))..(((((((((...(((((.((((((((((....((((((.((((((..((((.((.((((((..((...(((((....)))))...))..))).((((..((((..((((..(((.((((((((((((...........))))))..)))).)).)))(((..((...(((((....)))))...))..))).))))..))))..))))..))).))))))))))))....)))))).))))))..))))((((((.(((..((...(((((....)))))...))..))).(((((.(((.(.(((((.((((..((((((((((...((((((((.{..((((.{((((((.(.((((.((.((((({({....{((((.....))))|((((((....))))))}.((,{{,,{{,{,|||,{,,.|||,{....,,}.|,,|({((.{((,,,...}})))))}{||,..((((((.....)))))),.....((((.((....)).)))).....))))..,.)))))...)).)))).))))))).}.)))).}))))))))......{{(((((.(((((.(((......,{.((((...))))}..))).)))))..))))}.}}}))))))..))))...))))((((.((..{(((((....))))},,..))))))))))).).))).)))))))))))..((((......))))(((((..........)))}),)))))((....(((((((((..{(((((.((..((..((((((.,.(((((((((.({((.({{((((((((((...........))))))..))))...,)))}))}.(((((((((((...(((((..{((((((.(((((((....))))))){((((......,})))}....,|,........(((((((.(((..((((((((((((((.........((((..((((((((...((((.(((((.,...(((((......}.))))....))))).,((,(,({{{..,,|||{(((,(,(((((((.(((..|{|,{|||..|(|,||{|}}.(((((...{((......))}...))))),....|||{{|....({{.((((.....}))),}))....||||||.(((((.((((..((((((((({.....((((.{{....}).)))).....,|}}..,{{{|.{{(((.....))))|(((((.(((((((((((.(((.(((.((((((.....))).((((((.,.(((.(((.(((((......)))))))))))((.((((..(((((((((.((..((((((((((((.(((((,...{{.((((..(((((((((({.{{{,{{.}|||||{{{{..{{{{|||||{.,,||,,....}))))).,|}}}...}||}((((.((((.(((.(....((((((.....)))))).....).))))))).)))).....,,..)))))...))))})......}))))).)))).))))))))..)}(((({......}))))...((...((((((........))))))...))..)))))))))...)))).))..(((((((((((.,..{{{{,,..(((((.{.((......((((.....))))((((.{((.(((.(((.(((((......))))))))))).)).}...)))}(((((((...((((((.((((((((((.({......((((((((((((((((....((((.{{....}).)))).......)),,)))..........)))))))))).,)).))).))))))))){{....}}((((.....))))(((((((....))))))).......((((......))))((((,....,.))))..(((((((.(((((((.((..((......{((((((.....(((((((..(((((((.(((((..........)))))}).)))))..........((((((.((((,.{(((((((...((......((,{(((..((.((((((..,...,(((....})).,,}..)))))).))...))))))...))...)))))))))))).))..))))))))))).....))))))}.))..))))).)).)).).))))))(((((...(((((((((((({({((((.....(((((....)))))((....))))))))))))))))))))...))))).(((((((....))))))).))))..))))))))).,))))).})),...))))))))))),))))))...(((((((((.....(((((.......)))))...,.))))))))).))).)))))).))))))))))).....((((((((..(((((((((((.....))).})))))))..........)))))))).,,..))))))},,)))))))....)))).)))))..})))}},},)))))))))},}}).)))||}|(((((((.(.{({{((((.((((((((((((((.{{..,..,((((((,.{..{(((((....)))}}}}..}..))))))({(((((((.((((((.({,(((((((((((((.........))))....)))))))))..(((.(((..((((.(....((.(((.(.((((.((((((....)))))))))).).))).))..).)))).))).)))..,.}))))))).)))))))}...{{(((((((.(((((((...((((.(((..(({.{{.....}),))..))).))))...))))))).))|}}))))}((((.(.(((({..((.((((.(((..((((((((((......)))),...,)))))..))).)))).(((((...((((.........)))).)))))(((((....(((((((..(((((...{{{.(((......)))..)}.}..)))))..)))))))....)))))))..})))).)))))}},,,}})).))))))},))))).))))))),)....)))))))}}))})))})))).))))))))..))))((((((((..((((((........)))))).)))).))))..))))))))))))))..))))))))))|{||,.{{,((((((.((.{(..(((((((((..{((((((((((((.(.((....)).).))))))))((..((((((((((..{.(((({(((((.(((,,,...,,.......)}},|,}))).}}}}}.|.,||}}}}}.)))..))))))),))))))))).,)),))))}})).((((((((((.(((((({,{....((((.((..(((((((.((((((((,({....}}}..,,({{{({,....|||..|||||......((((((({....)))))))){{{{{((((.....))),.,,)))})),))))))))..))))))).)).)))).......,))))))).)))))))))).{((((((((((((((({,{{(((((((((((((|(({((.{{,|,{(((((((.....)))).))))}}.}}}}.{(({.,,,)}}}.......{{..{..{{{|,....(({,,({,...((((((.((((((.........))))))))))))((((.(((((..............))))).)))))))))),}}||)))}),.,,|}}..,..(({...})})).))))))))))))),||.......((((((.(((((((..(((((({(,{(((..,{{(({{{||{|,.||||||....,,,,,(({(((,,..............}}}||,(((((.....)))))|,...,(({....|||............{{(((((.......))))))}})}})),,,}))))),)|||,}}.,))))))))..))))))).)))))).,,,,{((({..(((((.{{...)).))))).))))},|.|{|||.{{|...}}}))))))))))))))))}.......|||....,|))}(((((.({{.({{(({({{.......))),.(((((((....)))))))(((((((((((((((((((((((((..(((.(((.,,,(((.......}}}.....,,.(((((((((......(((..((((....))))..)))...((((((((..(((((((,(,(({{{,(((((...)))))}))},,.,...,({(,(((((((..((((((,({({.((((...((,.({((((((((((.((((..(((((((({(((.((((((.{.((((((.....)))))).).)))).))...)).)),))))))))..))))..)).))))).)),)}))).)))).}.}))))))))..))))))).,.)).},.)))))))..)))))))).)))))))))))).)))..))))))))))))))))..((((..(((((.(((((..(((......}})....(.((((((((((......((((.((.,....,}),)))).((((.......}))),.))))))).))).)((((((..{({,(((...)))..)).)))))))))))((,,{{((((.....,,,,.)))))}..))))))).,.))))..((((.....))))...((((.(((((.,.(((((((,,.(((,.,(,,..,,,))}...)))))))},).))))).))))...)))).)))))((((.(((((..((...(((.(((((((.........))).}))).)))..,))..))))))))).....))).)))))).)))))...||,.)))))))...)))))..)))))).........)))))..{.(((....))).)))))))))).,.))))........((((.((((.(((((...((({....})))...))))))))).))))...))..)).)).)))))).)))))))))...))...((((((..(((...((.((((((((..((({..{(((....{.(((({(,..}}}}}}.}.}}))}}..{(((((((.(.(((((..,((((((((((..((((..((({,((.(((...))).))))))..))))..))).)))))))..))))).).))},))))))))..))))..)))).))...))).))))))))))))))).(((((.(.(((((((,{(((({((((((...(((((.....)))))........))))),},.)))).),)))))))).))))))))))))))))..))))))))).,.)}}}||,||}||....||{|||||{{.((,,..||{,|||||}}}}{{(,((({{,,.,,,||||{|||}|||||{..|||}(((..,.,({{{{{......})})))})},.)))})}.))))),)))....,)))),))),.))))))).))}}.))))))).,,.))))))).)))...))))...(((.{.....}.))).......(({{{....,....})}}}......

Transcripts

ID Sequence Length GC content
AGCUGCCAGCCGGGCCGGUCCGUCCUCCAGGGGACCCCGCGCAGUCCAG… 6502 nt 0.6241
AGCUGCCAGCCGGGCCGGUCCGUCCUCCAGGGGACCCCGCGCAGUCCAG… 6505 nt 0.6241
AGCUGCCAGCCGGGCCGGUCCGUCCUCCAGGGGACCCCGCGCAGUCCAG… 6452 nt 0.6234
AGCUGCCAGCCGGGCCGGUCCGUCCUCCAGGGGACCCCGCGCAGUCCAG… 6449 nt 0.6234
AGCUGCCAGCCGGGCCGGUCCGUCCUCCAGGGGACCCCGCGCAGUCCAG… 6484 nt 0.6238
Summary

Members of the perilipin family, such as PLIN4, coat intracellular lipid storage droplets (Wolins et al., 2003 [PubMed 12840023]).[supplied by OMIM, Feb 2010]

Forensic Context

A study in human iliopsoas skeletal muscle demonstrated that the protein marker PLIN4 can assist in estimating the post-mortem interval (PMI) between 24 and 120 hours [He et al. DOI:10.1007/s00414-025-03625-9].