Basic Information

Symbol
PLPPR4
RNA class
mRNA
Alias
Phospholipid Phosphatase Related 4 PRG-1 LPPR4 PHP1 KIAA0455 Brain-Specific Phosphatidic Acid Phosphatase-Like Protein 1 Lipid Phosphate Phosphatase-Related Protein Type 4 Phospholipid Phosphatase-Related Protein Type 4 Inactive 2-Lysophosphatidate Phosphatase PLPPR4 Plasticity-Related Gene 1 Protein PRG1 2-Lysophosphatidate Phosphatase PLPPR4 Plasticity Related Gene-1 Plasticity Related Gene 1 EC 3.1.3.4 LPR4
Location (GRCh38)
1:99264292-99309590
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Forensic tag(s)
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External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_014839.5
Sequence length
4824.0 nt
GC content
0.4138

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1298.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1390.20 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1334.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001166252.2 NCBI
AUCAGCGGCGCCGGGCGCUUGGGGCUGGAGGAGGCAGCUCGCCUCAGCU… 4650 nt 0.4142
NM_014839.5 NCBI
AUCAGCGGCGCCGGGCGCUUGGGGCUGGAGGAGGCAGCUCGCCUCAGCU… 4824 nt 0.4138
Summary

The protein encoded by this gene belongs to the lipid phosphate phosphatase (LPP) family. LPPs catalyze the dephosphorylation of a number of bioactive lipid mediators that regulate a variety of cell functions. This protein is specifically expressed in neurons. It is located in the membranes of outgrowing axons and has been shown to be important for axonal outgrowth during development and regenerative sprouting. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene.[provided by RefSeq, Oct 2009]

Forensic Context

A study in *Caenorhabditis elegans* demonstrated that the PLPPR4 protein, which binds 21U RNAs, is required for triggering 22G RNA production for silencing and is associated with reduced germ cell numbers and temperature-sensitive fertility [Wang et al. DOI:10.1038/s41580-022-00528-0].