Basic Information
Symbol
PLTP
RNA class
mRNA
Alias
Phospholipid Transfer Protein
BPIFE
BPI Fold Containing Family E
Lipid Transfer Protein II
HDLCQ9
Location (GRCh38)
20:45898621-45912235
Forensic tag(s)
Other applications
MANE select
Transcript ID
NM_006227.4
Sequence length
1889.0 nt
GC content
0.5956
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-730.77 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-763.71 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
470.84
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GCCAGACCCCGUCGCCCGGAUCCCCUGAGCUGCCCGCCAUCCCACGUGA… | 1604 nt | 0.5985 | |
| AUAAAGGCCAAGCCAGUCAUCAUAGGCGGGACCAGGCAGAUGGGCGUGG… | 1727 nt | 0.5819 | |
| GCCAGACCCCGUCGCCCGGAUCCCCUGAGCUGCCCGCCAUCCCACGUGA… | 1889 nt | 0.5956 | |
| GCCAGACCCCGUCGCCCGGAUCCCCUGAGCUGCCCGCCAUCCCACGUGA… | 1733 nt | 0.5949 |
Summary
The protein encoded by this gene is one of at least two lipid transfer proteins found in human plasma. The encoded protein transfers phospholipids from triglyceride-rich lipoproteins to high density lipoprotein (HDL). In addition to regulating the size of HDL particles, this protein may be involved in cholesterol metabolism. At least two transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]
Forensic Context
A study in mice demonstrated that intranasal paraquat exposure induced early gene expression changes in lung tissue, with the PLTP showing a time-dependent decrease of more than two-fold during the initial destructive phase (6 hours to 5 days post-exposure) [Tomita et al. DOI:10.1016/J.Tox.2006.12.005].