Basic Information

Symbol
PLVAP
RNA class
mRNA
Alias
Plasmalemma Vesicle Associated Protein PV-1 FELS PV1 Gp68 Fenestrated-Endothelial Linked Structure Protein; PV-1 Protein Fenestrated Endothelial-Linked Structure Protein Plasmalemma Vesicle-Associated Protein Plasmalemma Vesicle Protein 1 DIAR10
Location (GRCh38)
19:17351450-17377356
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_031310.3
Sequence length
2290.0 nt
GC content
0.6031

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-875.27 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -909.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 429.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((((.((((.(((.(((((((((.((((.(((...(((.(((((.(.....).))))).))).))).))))(..(((((....(((.(((..((((((((....((((((((..(((.((...((.((((((((.(((((((((((((((((.((...(((.((.((......((((((((((((......((.((((....)))).))..)))))).))))))...(((.(((((..((.((.....))))..)))))...))).((((((((..(((.((.(((((((((((((..(((..((..((((.....)))).(((..((((.(.((.((((((.(((....)))))))...)).)).).))))...)))..(((((((..((((((((((((((.(((..(((((((...)))))))..........((((.(((((.((((((.(.(((((((.((((....(((.(((((.......((((......))))......))))).))).....(((((((.((........))))))))))))).))))))).).)))))).((......))....((.((........))...))))))).))))......)))))))))).....))))))))).))))).......((((((((..((((.....((((.(((((.(((..(((.((...((((.....)))).)))))..))).)).(((.....)))..........(((((......((((((((((..((((........)))).)))))((.((....)).)))))))........)))))...)))))))(((.(((((((((....((.((((((.(..((((.......(((((.((((((((........)))))).(((((((...)))))))...........((.(((((((((((.........)))....(((....(((((....)))))..)))..)))))))))))).)))))..........))))....).))))))..))...)))))))))..)))..))))...)))))))).....(((((....))))).))..)))..)).)))).)).)))..........))))))).)))))))))).))))))).)))))))))))))......)))).)))).))))))...)).)))))))))))(((((..((((((........(((....)))))))))..)))))..((((....))))))))))))..)))..))).....)))))..)..((((...(((.((((.((......)).)))).)))...))))...(((((((....)))))))........((((((((.(((((((..((((..(((((....((((.(((....(((((.(((((((((((((((((((((..((((......((((..................................)))).......)).))..)))))))))..........................(((....))).....((....(((.....)))....))(((((((.(((((((((((((........))).))))))))....)).)))))))(((((.(((..((((.......(((((((((...........)).)))))))((((.((((.....))))))))........(((((((..((((((.(((((..(((.(((((......).)))).)))(((((((((..((((..........((((((.........(.(.(((((((((((.....))).))))))))).).........))))))..........))))..)))))..........))))............)).))))))))).........(((((...................)))))...)))))))..(((.((((......)))).)))..))))..))).))))).))).))))).))))))))).....)).).)))).)))))..))))...))))))))))))))).((((((((((.(.(((.((.(((.((((.(.(..(.((((((.(((((((((........))).)))))))))))).)..).))))).))).)).).)))))))))))))))).))))))...((((((((((...)))).))))))...))).)))).)))))))(((.((((.........))).).))).......................
Thermodynamic Ensemble Prediction
{(.(((((.((((.(((,(((((((((.((((.(((...(((.(((((.(.....).))))).))).))).)))){,.(((((....(((.(((..((((((((....((((((((..(((.,,..,((.((((((((.(((((((((((((((((.((...(({{((.,{......((((((((((({..{(((,,.,(((....))))..)}})))))).))))))...(((.(((((..((.((.....))))..)))))...))).((((((((..((({(,,(,(((((((((((..(((..((...(((({,..((((.(((((((((,(.((.{(((((.(((....)))))))...}}.}).},)))).(((((.{(((((((..(((((((((((((({(({..(((((((...)))))))..........((((.(((((.((((((.(.(((((((.((((..,.(((.(((((.......((((......))))......))))).))).},..(((((((.((,...,,,.,,))))))))))).))))))).).)))))).((......))..,.,{.,,........},...,}))))).)))).....,)),))))))).....))))))))),})))).}.....)))))(((({,.((.......))..}})))(((..(((.((...((((.....)))).)))))..))){((((((({,{..,.,...(((((((((((((((((........,,))))}..)))))|{(((......(((((((....((((((((...((((((((......{(((((((({.{{(((.......(((((...))))).......)}).}}..}}.})))),)}}.))))))))...))))))))....))))))))))},}}}}}},,}|((((((({{{.........})),...{({....(((((....))))).,)))..)))))))})))))).)))}........))))).))))..)))))..({{{(((((....((((...)))).....))))))))....(((((....))))).))..)))..)).)))).)),,))..}}.,....,}})))).)))))))))}.)))}})).)))))))))))))......)))).)))).))))}}.,,},.))}))))))))(((((..((((({.......,({{....))}))))))..)))))..((((....))))))))))))..)))..))).....)))))..,..((((...(((.((((.{(,,....)),)))).)))...))))...(((((((....)))))))........((((((((.(((((((..((((..(((((...,((({.(((,,{.{{{((.(((((((((((((((((((((..(({(....{{(,,,,..............,}}.{{{{...........)))).......,).))..)))))))))...........|,....,,,......(((....}}}.,...{{....(((.....)))....})(((((((.(((((((((((((........))).))))))))....)).))))))){{((({(((,{(({|..}}}}.|||||||{{..,,,......|}.|||||}|((((.,,,,..}}}))}))).}...,.,..(((((((..((((((.((((,..(((.((((,......).)))).)))(((((((((.,((({..........{((({{...,.|,,,|.{.(((((((((((.....))).)))))))}|.}.........))))))..........})})..}}}},.........,)))}............}}.})))))))).........{({{{...................}))))...)))))))..(((.((((......)))).))).......{|||...)))})))}}}))).}))))))))},...,}.)})}}}.)))))..))))...))))))))))))))).((((((((((.(,{{{.((.(((.((((.(.(..(.(((((,{(((((({{{.,,,,...))),)))))))))))).)..),})))).))).)).).)),))))))))))))).)))))}...((((((((((...))))}}))))).,,))).)))).))))))}(((.((((.........})).).))).......................

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_031310.3 NCBI
AGAGCAGGCCUGGUGGUGAGCAGGGACGGUGCACCGGACGGCGGGAUCG… 2290 nt 0.6031
Summary

Predicted to enable identical protein binding activity. Involved in MAPK cascade; positive regulation of cellular extravasation; and tumor necrosis factor-mediated signaling pathway. Located in caveola and cell surface. Implicated in congenital diarrhea. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in mice and humans demonstrated that the PLVAP is an endothelial-specific protein upregulated in ischemic hearts, which regulated human endothelial proliferation in vitro and promoted endogenous neovascularization [Li et al. DOI:10.3389/fcvm.2022.768834].