Basic Information

Symbol
PLXDC2
RNA class
mRNA
Alias
Plexin Domain Containing 2 TEM7R PLXDC2-OT Tumor Endothelial Marker 7-Related Protein Plexin Domain-Containing Protein 2 FLJ14623 Tumor Endothelial Marker 7-Related Precursor 1200007L24Rik
Location (GRCh38)
10:19815943-20289856
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032812.9
Sequence length
12275.0 nt
GC content
0.3974

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-3421.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3654.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3391.57
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001282736.2 NCBI
AGACUGCUGCAGCCCUAACCUUCCCAGGGCUCAGCUCUUUGGAGCUGCC… 12128 nt 0.3974
NM_032812.9 NCBI
AGACUGCUGCAGCCCUAACCUUCCCAGGGCUCAGCUCUUUGGAGCUGCC… 12275 nt 0.3974
Summary

Predicted to be located in membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the PLXDC2 as a shared upregulated differentially expressed gene in adult human hypertrophic cardiomyopathy [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4]. In a separate study in mice, the PLXDC2 was found to be upregulated in common in white blood cells at day 1 post-injury in models of burn and trauma-hemorrhage, associated with cellular development pathways [Lederer et al. DOI:10.1152/physiolgenomics.00086.2007].