Basic Information

Symbol
PLXNA1
RNA class
mRNA
Alias
Plexin A1 NOV PLXN1 Semaphorin Receptor NOV PLEXIN-A1 Plexin-A1 Plexin 1 DWOPNED NOVP
Location (GRCh38)
3:126982693-127037389
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_032242.4
Sequence length
9309.0 nt
GC content
0.6214

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4094.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4242.46 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2403.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_032242.4 NCBI
AUUCAUGCUGGGCAUCGGCUGCGCGGCCACGCAGCGGAGCCCGGGCGCG… 9309 nt 0.6214
Summary

Predicted to enable semaphorin receptor activity. Predicted to be involved in several processes, including T cell activation via T cell receptor contact with antigen bound to MHC molecule on antigen presenting cell; nervous system development; and semaphorin-plexin signaling pathway. Predicted to act upstream of or within dichotomous subdivision of terminal units involved in salivary gland branching; neuron projection extension; and regulation of smooth muscle cell migration. Located in cytosol and nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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