Basic Information

Symbol
PLXNA2
RNA class
mRNA
Alias
Plexin A2 OCT Semaphorin Receptor OCT Plexin-A2 KIAA0463 PLXN2 Transmembrane Protein OCT FLJ11751 FLJ30634 Plexin 2
Location (GRCh38)
1:208022242-208244850
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_025179.4
Sequence length
11508.0 nt
GC content
0.5423

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-4246.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -4444.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 3700.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_025179.4 NCBI
GAUAAUGAGCUGCAUGGUGAAAUAGGGAGGCCGGCGCUCAGGGCUCCUC… 11508 nt 0.5423
Summary

This gene encodes a member of the plexin-A family of semaphorin co-receptors. Semaphorins are a large family of secreted or membrane-bound proteins that mediate repulsive effects on axon pathfinding during nervous system development. A subset of semaphorins are recognized by plexin-A/neuropilin transmembrane receptor complexes, triggering a cellular signal transduction cascade that leads to axon repulsion. This plexin-A family member is thought to transduce signals from semaphorin-3A and -3C. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in rhesus macaques identified the PLXNA2 as a shared upregulated differentially expressed gene in left ventricular tissue from animals with hypertrophic cardiomyopathy compared to adult human HCM cases [Rivas et al. DOI:10.1038/s41598-024-82770-4].