Basic Information

Symbol
PLXND1
RNA class
mRNA
Alias
Plexin D1 KIAA0620 Plexin-D1 PLEXD1 CHTD9
Location (GRCh38)
3:129555213-129606681
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_015103.3
Sequence length
6913.0 nt
GC content
0.6298

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2974.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -3094.75 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 2207.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_015103.3 NCBI
AUGCACUCGCCGCGCCGCGCAGCCCGCGCACGCCCGGAUGGCUCCUCGC… 6913 nt 0.6298
Summary

Enables protein domain specific binding activity. Predicted to be involved in several processes, including positive regulation of axonogenesis; semaphorin-plexin signaling pathway; and synapse assembly. Predicted to act upstream of or within circulatory system development; dichotomous subdivision of terminal units involved in salivary gland branching; and kidney development. Located in lamellipodium. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

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