Basic Information

Symbol
PNMA6A
RNA class
mRNA
Alias
PNMA Family Member 6A PNMA6C Paraneoplastic Ma Antigen Family Member 6C Paraneoplastic Ma Antigen Family Member 6A Paraneoplastic Antigen-Like Protein 6A MGC15827 Paraneoplastic Antigen-Like 6A Related Protein Paraneoplastic Antigen-Like Protein 6C Paraneoplastic Antigen Like 6A Paraneoplastic Antigen Like 6C PNMA6 MA6
Location (GRCh38)
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis

MANE select

Transcript ID
NM_032882.6
Sequence length
2238.0 nt
GC content
0.6501

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1091.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1128.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 716.27
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
CCAAACGCCGAGCGAGCGAGGGAGAGGCACAGUCAGAGGGAACGCCCGC… 2238 nt 0.6501
Summary

No relevant information is available at the moment.

Forensic Context

A study in humans identified PNMA6A as a differentially expressed gene among the top 10 by P-value when comparing the 7-day post-acute myocardial infarction (AMI) time point to the 3-month post-AMI time point in peripheral blood mononuclear cells [Wang et al. DOI:10.1038/s41598-024-60945-3].