Basic Information

Symbol
PNMA8A
RNA class
mRNA
Alias
PNMA Family Member 8A PNMAL1 Paraneoplastic Ma Antigen Family Member 8A Paraneoplastic Ma Antigen Family Like 1 Paraneoplastic Antigen-Like Protein 8A PNMA-Like Protein 1 KIAA1183L FLJ10781 PNMA-Like 1
Location (GRCh38)
19:46466491-46471563
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_018215.4
Sequence length
3684.0 nt
GC content
0.5147

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1359.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1426.15 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 741.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001103149.2 NCBI
AGUGCGCAGGCGCGCGCUGCGACGCCAACCUCGGCUUCUCGCCGCUAAC… 3479 nt 0.5091
NM_018215.4 NCBI
AGUGCGCAGGCGCGCGCUGCGACGCCAACCUCGGCUUCUCGCCGCUAAC… 3684 nt 0.5147
Summary

PNMA8A belongs to the paraneoplastic Ma antigen (PNMA) family (review by Pang et al., 2018). [supplied by OMIM]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the PNMA8A was consistently up-regulated across seven brain regions in ethanol-naïve HDID-1 mice genetically selected for binge drinking compared to control mice, with a fold change range of 1.20–1.39 [Ferguson et al. DOI:10.1007/S12035-018-1252-0].