Basic Information
Symbol
PNOC
RNA class
mRNA
Alias
Prepronociceptin
PPNOC
N/OFQ
NOP
Orphanin FQ
Nocistatin
OFQ
Pre-Pro-N/OFQ
Pronociceptin
Nociceptin
PpN/OFQ
Location (GRCh38)
8:28316986-28343355
Forensic tag(s)
-
MANE select
Transcript ID
NM_006228.5
Sequence length
1060.0 nt
GC content
0.5660
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-391.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy:
-415.56 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
199.24
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.((((((((.(((......))).).))))).))(((((((((..(((.(((((((.((((((..(((((....((((((....(.((((..(((((((..((..((.......))..))..))))))).)))).)))))))(((((.(((((((((....((((...((.(((((((((((((((.((((.((((.......)))).)).))..((((..(((........)))..))))((((((((((.((....)))))).((.((((((((((((((...(((...((((((.((.....)).)))))).)))..))....))))))))))))))....((((...))))(((....)))..))))))))))).)).)))))).)).))..)))).....)))))))))...))))))))))....))))))))))))).)))...........(((((((.....((((...((((...((((((....))))))((((((..((((......(.((((..(((((((.((..((.((((.((..((......))..)).(((((((((.....((((...))))...)))).)))))...((((((((......((.((.......)).)).......)))))))).((.((((.........(((.((((((((.........((((....(((((..(((...)))..)))))...)))))))))))).))).)))))).))))))..)))))))))..)))))...)))))))))).)))).)))))))))))(((((.((..............((.(((.....((((.(.(((.....))).)))))))).))((..((((.(((((((((..(((((.((...(((((...((((((...)))))))))))....)).)))))....))...)))))))))))..))..)))))))..((......))...)))))))))......((..(((((((......)))))))..))........(((....))).....))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{((,{(((((((.(((......}))}),))))).}}(((((((((,.(((.((((((,{((((((..(((((....((((((....{.((((..(((((((..((..((.......))..))..))))))).)))).}))))))(((((.(((((((((....((((..,({.((((((((((((((((((.((((((((((((((.{{{{{.,.{{(((...,,}}}}}.,,,|,,..,|||||.,.(((((.((....)))))))||,|{((((((((((,{...(((...((((((.((.....)).)))))).))}........)))))))))))))).)))))},)))))..(((....)))))).)),})))))},),}))))).)).))..)))).....)))))))))...))))))))))....))))))))))))).))).,.........(((((((.....((((...((((...((((((....))))))(((((({.{(((...,{.{.((((..(((((((.,,{(((..((((((((((,({...,,,.,,.(((((((((..,..((({...})))...)))).)))))..,((({{{{{..,,,.||||{...}},.}}})),......}}}}}}}}.((.,...,,,...,,.)),.})))))))..))))...,{{{,,,,(((((..(((...)))..)))))..,))),..(((.((((((.......)))))))))),)))))))..))))),..)))))))))).)))).)))))))))))(((((,({......,{{....,||,{{{|....{(((.{,{(,...,.)}}.}))))}}}...{{..((((.((((((({{,.(((((.((.,.{(((,..{((((((...)))))))))))...,)).)))))....))...)))))))))))..))..,.})))}..,,......}}...)))))))))......{{..(((((((......)))))))..,|,,......,{{....)))..,.})))}..
Transcripts
| ID | Sequence | Length | GC content |
|---|---|---|---|
| GAGAACAAAAUAAAAUUCUUUAUGGGUGACAGUCAUGAGCUGUGCUUGG… | 1004 nt | 0.5428 | |
| AACCGAGCCUCGCAUCCAUCGGAGGGAGCCGGGGACUGACAGCUCUCAG… | 1060 nt | 0.5660 |
Summary
This gene encodes a preproprotein that is proteolytically processed to generate multiple protein products. These products include nociceptin, nocistatin, and orphanin FQ2 (OFQ2). Nociceptin, also known as orphanin FQ, is a 17-amino acid neuropeptide that binds to the nociceptin receptor to induce increased pain sensitivity, and may additionally regulate body temperature, learning and memory, and hunger. Another product of the encoded preproprotein, nocistatin, may inhibit the effects of nociceptin. [provided by RefSeq, Jul 2015]
Forensic Context
No relevant information is available at the moment.