Basic Information

Symbol
POLA1
RNA class
mRNA
Alias
DNA Polymerase Alpha 1, Catalytic Subunit P180 POLA Polymerase (DNA) Alpha 1, Catalytic Subunit DNA Polymerase Alpha Catalytic Subunit P180 DNA Polymerase Alpha Catalytic Subunit EC 2.7.7.7 NSX N Syndrome (Mental Retardation, Malformations, Chromosome Breakage) Polymerase (DNA Directed), Alpha 1, Catalytic Subunit Polymerase (DNA-Directed), Alpha (70kD) Polymerase (DNA Directed), Alpha VEODS PDR
Location (GRCh38)
X:24693864-24996986
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_001330360.2
Sequence length
5487.0 nt
GC content
0.4294

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1520.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1633.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1447.33
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001330360.2 NCBI
GCCAGUUUUGGGCUGGUUGGCGCGGAAUCGGGAGAUUCGGGACCAUGGC… 5487 nt 0.4294
NM_001378303.1 NCBI
GCCAGUUUUGGGCUGGUUGGCGCGGAAUCGGGAGAUUCGGGACCAUGGC… 5412 nt 0.4302
NM_016937.4 NCBI
GCCAGUUUUGGGCUGGUUGGCGCGGAAUCGGGAGAUUCGGGACCAUGGC… 5469 nt 0.4288
Summary

This gene encodes the catalytic subunit of DNA polymerase, which together with a regulatory and two primase subunits, forms the DNA polymerase alpha complex. The catalytic subunit plays an essential role in the initiation of DNA replication. [provided by RefSeq, Mar 2010]

Forensic Context

A study in humans using post-mortem tissue RNA sequencing demonstrated that the POLA1 gene was downregulated as part of the inhibited telomere maintenance pathway specifically in the lungs of individuals who succumbed to septic shock [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].