Basic Information

Symbol
POLB
RNA class
mRNA
Alias
DNA Polymerase Beta Polymerase (DNA Directed), Beta 5'-Deoxyribose-Phosphate Lyase Polymerase (DNA) Beta 5'-DRP Lyase AP Lyase DNA Polymerase Beta Subunit DNA Pol Beta EC 4.2.99.18 EC 4.2.99.- EC 2.7.7.7
Location (GRCh38)
8:42338454-42371808
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002690.3
Sequence length
1290.0 nt
GC content
0.4326

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-375.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -397.88 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 292.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002690.3 NCBI
AUUGUUCCGCCGGUCGCGCCGGAGCUGGGUUGCUCCUGCUCCCGUCUCC… 1290 nt 0.4326
Summary

The protein encoded by this gene is a DNA polymerase involved in base excision and repair, also called gap-filling DNA synthesis. The encoded protein, acting as a monomer, is normally found in the cytoplasm, but it translocates to the nucleus upon DNA damage. Several transcript variants of this gene exist, but the full-length nature of only one has been described to date. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Forensic Context

A study in humans using post-mortem tissue RNA sequencing demonstrated that the POLB gene, involved in DNA repair, was downregulated as part of the inhibited base excision repair pathway specifically in the lungs of sepsis patients compared to uninfected controls [Pinheiro da Silva et al. DOI:10.1111/jcmm.17938].