Basic Information

Symbol
POLD2
RNA class
mRNA
Alias
DNA Polymerase Delta 2, Accessory Subunit DNA Polymerase Delta Subunit P50 Polymerase (DNA Directed), Delta 2, Regulatory Subunit 50kDa Polymerase (DNA) Delta 2, Accessory Subunit DNA Polymerase Delta Subunit 2 Pol Delta B Subunit (P50) Polymerase (DNA Directed), Delta 2, Regulatory Subunit (50kD) Polymerase (DNA Directed), Delta 2, Accessory Subunit DAN Polymerase Delta 2, Accessory Subunit EC 2.7.7.7
Location (GRCh38)
7:44114631-44124407
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006230.4
Sequence length
1609.0 nt
GC content
0.5942

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-629.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -659.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 469.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001127218.3 NCBI
AGGCGCGCGGGGAUUGGCGGGAUGCGGCGCGCCGCGCGGGUGAGACAUC… 1782 nt 0.5864
NM_001256879.2 NCBI
AGGCGCGCGGGGAUUGGCGGGAUGCGGCGCGCCGCGCGGUGAGUGGGGU… 2205 nt 0.5955
NM_006230.4 NCBI
AGGCGCGCGGGGAUUGGCGGGAUGCGGCGCGCCGCGCGUGAACCUCCUU… 1609 nt 0.5942
Summary

This gene encodes the 50-kDa catalytic subunit of DNA polymerase delta. DNA polymerase delta possesses both polymerase and 3' to 5' exonuclease activity and plays a critical role in DNA replication and repair. The encoded protein is required for the stimulation of DNA polymerase delta activity by the processivity cofactor proliferating cell nuclear antigen (PCNA). Expression of this gene may be a marker for ovarian carcinomas. Alternatively spliced transcript variants encoding multiple isoforms have been observed for this gene, and a pseudogene of this gene is located on the long arm of chromosome 5. [provided by RefSeq, Mar 2012]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.