Basic Information

Symbol
POLD3
RNA class
mRNA
Alias
DNA Polymerase Delta 3, Accessory Subunit DNA Polymerase Delta Subunit P66 KIAA0039 PPP1R128 P66 P68 Polymerase (DNA-Directed), Delta 3, Accessory Subunit Protein Phosphatase 1, Regulatory Subunit 128 Polymerase (DNA) Delta 3, Accessory Subunit DNA Polymerase Delta Subunit P68 DNA Polymerase Delta Subunit 3 DNA Polymerase Delta Subunit C Pol Delta C Subunit (P66) IMD122
Location (GRCh38)
11:74493851-74669117
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Drug abuse diagnoses
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_006591.3
Sequence length
3788.0 nt
GC content
0.4263

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1060.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1132.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 984.66
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001363597.2 NCBI
AAAGACGUUUCCCGCCGGCGGGAGCUGUGGCUGUGAUUGAGAGAGGGGU… 4001 nt 0.4406
NM_006591.3 NCBI
AAAGACGUUUCCCGCCGGCGGGAGCUGUGGCUGUGAUUGAGAGAGGGGU… 3788 nt 0.4263
Summary

This gene encodes the 66-kDa subunit of DNA polymerase delta. DNA polymerase delta possesses both polymerase and 3' to 5' exonuclease activity and plays a critical role in DNA replication and repair. The encoded protein plays a role in regulating the activity of DNA polymerase delta through interactions with other subunits and the processivity cofactor proliferating cell nuclear antigen (PCNA). Alternatively spliced transcript variants have been observed for this gene. [provided by RefSeq, Mar 2012]

Forensic Context

A study in mice demonstrated that the POLD3 was selected from a microarray analysis of heart tissue following methamphetamine administration and restraint, but quantitative RT-PCR validation did not show a statistically significant change in its mRNA expression [Shinone et al. DOI:10.1016/J.Legalmed.2010.01.001].