Basic Information

Symbol
POLE2
RNA class
mRNA
Alias
DNA Polymerase Epsilon 2, Accessory Subunit DPE2 DNA Polymerase Epsilon Subunit B Polymerase (DNA Directed), Epsilon 2 (P59 Subunit) Polymerase (DNA) Epsilon 2, Accessory Subunit DNA Polymerase Epsilon Subunit 2 DNA Polymerase II Subunit 2 Polymerase (DNA Directed), Epsilon 2, Accessory Subunit EC 2.7.7.7
Location (GRCh38)
14:49643555-49688422
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002692.4
Sequence length
1692.0 nt
GC content
0.3966

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-440.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -473.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 511.19
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001197330.2 NCBI
AAAUCGCAAAUAUGGCGCCGGAGCGGCUGCGGAGCCGGGCGCUCUCCGC… 1614 nt 0.3996
NM_001197331.3 NCBI
AAAUCGCAAAUAUGGCGCCGGAGCGGCUGCGGAGCCGGGCGCUCUCCGC… 1626 nt 0.3936
NM_001348384.2 NCBI
AAAUCGCAAAUAUGGCGCCGGAGCGGCUGCGGAGCCGGGCGCUCUCCGC… 1689 nt 0.3967
NM_001348385.2 NCBI
AAAUCGCAAAUAUGGCGCCGGAGCGGCUGCGGAGCCGGGCGCUCUCCGC… 1696 nt 0.3962
NM_002692.4 NCBI
AAAUCGCAAAUAUGGCGCCGGAGCGGCUGCGGAGCCGGGCGCUCUCCGC… 1692 nt 0.3966
Summary

DNA polymerase epsilon, which is involved in DNA repair and replication, is composed of a large catalytic subunit and a small accessory subunit. The protein encoded by this gene represents the small subunit (B). Defects in this gene have been linked to colorectal cancer and to combined immunodeficiency. [provided by RefSeq, Jan 2017]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.