Basic Information

Symbol
POLQ
RNA class
mRNA
Alias
DNA Polymerase Theta POLH Polymerase (DNA Directed), Theta Polymerase (DNA) Theta Epididymis Secretory Sperm Binding Protein DNA Polymerase Eta PRO0327
Location (GRCh38)
3:121431426-121546002
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Cause of death analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_199420.4
Sequence length
8757.0 nt
GC content
0.4097

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-2420.62 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -2594.35 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 1988.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_199420.4 NCBI
GAGUUUGAAGACUGGCGGGAAGAUGUCCGCAGCUGUUGCCAGGCCAGGG… 8757 nt 0.4097
Summary

Enables several functions, including catalytic activity, acting on DNA; identical protein binding activity; and magnesium ion binding activity. Involved in DNA metabolic process; negative regulation of double-strand break repair via homologous recombination; and protein homooligomerization. Located in Golgi apparatus; cytosol; and nucleoplasm. Is active in mitochondrial nucleoid; nucleus; and site of double-strand break. [provided by Alliance of Genome Resources, Jul 2025]

Forensic Context

A study in humans identified POLQ as a novel diagnostic biomarker for burn injury, showing it was significantly upregulated in burn tissues (p < 0.0001) with an area under the curve (AUC) > 0.9, indicating high diagnostic efficacy [Zhou et al. DOI:10.3389/fgene.2022.829841].