Basic Information

Symbol
PON1
RNA class
mRNA
Alias
Paraoxonase 1 ESA PON Serum Paraoxonase/Arylesterase 1 Serum Aryldialkylphosphatase 1 Aromatic Esterase 1 Arylesterase 1 A-Esterase 1 Esterase A PON 1 K-45 Serum Aryldiakylphosphatase Arylesterase B-Type Paraoxonase B-Type EC 3.1.1.81 EC 3.1.1.2 EC 3.1.8.1 MVCD5
Location (GRCh38)
7:95297173-95324710
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Chronological age estimation
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000446.7
Sequence length
2393.0 nt
GC content
0.4112

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-646.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -691.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 714.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.(((((..(((((((........))))))).......(((((((((((....((.((.((.....))..)).))...)))))))))))((((.((((((((((.(((....((((((..........(((........((((...))))........))).(((((((((.((((......(((((.....((((((.(((((.(((..((((.((((.((((((((...((((((.........((((((..(((..((....))..)))..))))))..........))))))...........((((((((((((((.........(((((..((((......)))).))))).(((((((((..(((((((((((((((((((((((....))).)))...........)))))))))).((((((.......((((((((.........(((((((((.((((...)))).)))..............(((((........)))))))))))....)))))))).......((((((((..((((((((..((((...(((((((.................((((((.((((((((......((.(((((.....((((.((......))))))...))))).)).)))))))).)).))))..)))))))...))))..))))))))...))))))))(((((.(((.....))).))))).............))))))(((((((.((((((..((((((............))))))..))))))....)))))))....(((.......)))(((((((((....)))))))))...((((.((((.(((....)))..)))))))).((((((..(((((((((..(((((((....)))))))(((....)))......)))))))))....)))))))))))))..)))).....)))))....((((......))))............))))))))).)))))....(((......))).))))))))(((((..((((........)))).)))))..((((((((((((((((.....(((((........)))))....((((....)))).......(((.(((...))).))).............((((((((((((...(((...((((((((.............))))))))..))).))))))).))......)))....))))))))).(((((((((.((((.(((((((((...(((......)))..))))).)))).)))).)))(((..((..(((.....)))..))))).....((((.............))))....)))))).)))))))((((.(((((.......))))).))))(((...((((((....((((((((((((..((((.((.((((....)))).))(((.(((((...((((((......))))))))))).))).)))).....))))))).)))))......))))))......))).))))))))..))))))))........(((((...((.((........)))).)))))...(((((((((((((.....)))))))))))))...............))))))...)))))......)))).....((((((....(((.....((((....(((((...((((...(((....((((((((......)).))))))....((((.((((.(((((.(((....))).))))).)))).))))......)))....))))......)))))...)))).....)))...))))))))))))))).......(((((....((((.((...)).))))....)))))..((((.((.(((...))).)))))))))))).....))).)))))).)))).))))))))).))))))..((((((...))))))...(((((..(((((((.................((((((........(((((((((((.(((((...........((((((..((((..(((.((((.......((((.........)))).......)))).))).....))))..)))))).......))))))))))))))))))))))...(((((((...)))))))(((.(((....))).)))(((((....((.(((((.((((((((((((..................))))))))))))........)))))))..)))))(((..((((((((((((.((.......))))))))).)))))..)))..(((((.(((((...))))).))))))))))))..)))))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.(((.,((({(((((((.,,{{.,{{{{{|||,.,...{{((((((((((....((.((.((.....}),,)).))...)))))))))))}}.|||,.{{{{((((,,(({((((({{{(.,{(((..,,({.,,....,,((({{{{|.|,,....,{,||.,,..((((((((((.....))))),.}))))}},..,,}))....}},},)))))))}...,|||....((((((.........((((((..(((..((....))..)))..))))))..........)))))),{{{,......||||,.|||,,||,.,.,,}},,),}}(((((((((.{...(((((((.((((,{{{(({..{{(({{{{{{(((((({{,,{((.,,,|||.|||,,..,,,,,,{|||}}}}}}}.{{{{{{,.,....(((((((....))).)}}}.((((({((((({{{{{{|{({{{{{{{{{{...{{{((,,{,......,|,,,,)).|||........,.||,......|||||{{{.,||||||||,,|,{{...|||||||,,}.}}.|},....}}}||||{,.((((((((......((.(((((.....((({.((......}}))))...))))).)).)))))))),|||{|||{{|}},|||.,,}|||,,|||||||}..,|||||||},,,,,.,|||||||}.|{|}}}}....,,}},,},},||||||{(|||{||{{{((..(((({{.,{{,.,,,,,,}}}}}}..}|}}}},...})})))}..,}|||||,||,....{||||||||,...)))))))},...,,.|}||||}}}}}}}}}}}}}}}.((((..((((((..((((((((({{(((((((....))))))){{,....,}}.,},..)))))))))....))))))..))))((((.((((......{({....})}....)))).})))...,,,,,,|||||||,{,{{(({.{,((((.,{{{{|||.{(((||,.|,|||}}}|||||{|,{,,.(((....(((.((((((,...,((((......(((((........)))))..,}}},.)))))).)))))).||{|}|||},,))),|)}}....,|,||,..|}}||||||{||,.|{||,.,(({(((((......,,,,,..)}}))))),,)),.,)))})).,,..,}}}}}},}}}}}|||||||.,,,{(((((.((((.(((((((((...(((......)))..))))).)))).)))).)))|||..,,..{((.....}}|,,|{|||.....,{{{...........,,))}),..,,|||||{{{{||..{{{{|{{{{,......|||}||{||||.......,..............(((((((((((((((((.(((((((.(({.(.((({{((.((.((((((......))))))..)).)))))),)...)).))))))))))).(((((..(((.(((.....))))))..))))).))))).....))))))))...{{((.(((........))).)))),....(((((((((((((.....))))))))))))),{{{{{{{...,,.....||,,,,,,,,....,,{{{||........,.}))}.......,.,|||,|..{{{,...,|||,.......,..{{{{{{{|,,,.,.,},)})))}..,,,..,.,,....}))))))|..}})))})}))},,,)}}))})}},},.}}},}}))))},,,}}}},}}}}}}}}))}|(((((((...)))))))},((((((((((..(((((....((((.({...}).))))....)))))..)))))})}}))...)))))))))))...).))))))))),,},)))))}})))),))))))))))}...(((((,...,)))))....,|,,{.((((((({................{{(({{,......{(((((((((((.(((((...........((((((..((((..(((.((((,{{..,,({{{.........)))}.}},,,.)))).))).....))))..)))))),,.....)))))))))))))))))}}}},...(((((((...))))))){((.(({....})).)))((((,.,,,((,(({(({.,{(((((((({........,,}}},}}},))))))}}}))||.....,,)))}))),.}))))(((..((((((((((((.((.......)))))))))},))))..)))..{((((.(((((...))))).)))))))))))),)))..))).

Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000446.7 NCBI
AGAGCCUCCUAGCCCGUCGGUGUCUGCGCCCAUCGAUCCCUUUGUCUAU… 2393 nt 0.4112
Summary

This gene encodes a member of the paraoxonase family of enzymes and exhibits lactonase and ester hydrolase activity. Following synthesis in the kidney and liver, the enzyme is secreted into the circulation, where it binds to high density lipoprotein (HDL) particles and hydrolyzes thiolactones and xenobiotics, including paraoxon, a metabolite of the insecticide parathion. Polymorphisms in this gene may be associated with coronary artery disease and diabetic retinopathy. The gene is found in a cluster of three related paraoxonase genes on chromosome 7. [provided by RefSeq, Aug 2017]

Forensic Context

A study in human blood plasma demonstrated that the PON1 (PON1) was significantly downregulated with age and was utilized as part of a 21-protein panel for chronological age prediction [Salignon et al. DOI:10.18632/aging.204787]. The proteomic model incorporating this biomarker achieved a prediction accuracy of R² = 0.59 ± 0.02, and its combination with miRNA data further improved the model to R² = 0.70 ± 0.01.