Basic Information

Symbol
POU1F1
RNA class
mRNA
Alias
POU Class 1 Homeobox 1 GHF-1 PIT-1 Growth Hormone Factor 1 POU1F1a PIT1 Pituitary-Specific Positive Transcription Factor 1 Pituitary Transcript Factor 1 POU Domain, Class 1, Transcription Factor 1 POU Domain Class 1, Transcription Factor 1 CPHD1 GHF1
Location (GRCh38)
3:87259404-87276584
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
-
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000306.4
Sequence length
1488.0 nt
GC content
0.3810

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-351.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -382.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 323.79
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000306.4 NCBI
AGAGCCUUCCUGAUGUAUAUAUGCAGGUAGUGAGAAUUGAAUCGGCCCU… 1488 nt 0.3810
NM_001122757.3 NCBI
AGAGCCUUCCUGAUGUAUAUAUGCAGGUAGUGAGAAUUGAAUCGGCCCU… 1566 nt 0.3825
Summary

This gene encodes a member of the POU family of transcription factors that regulate mammalian development. The protein regulates expression of several genes involved in pituitary development and hormone expression. Mutations in this genes result in combined pituitary hormone deficiency. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

No relevant information is available at the moment.