Basic Information

Symbol
POU3F4
RNA class
mRNA
Alias
POU Class 3 Homeobox 4 BRN4 OTF9 Octamer-Binding Transcription Factor 9 Brain-4 DFNX2 Brain-Specific Homeobox/POU Domain Protein 4 POU Domain, Class 3, Transcription Factor 4 OTF-9 DFN3 POU Domain Class 3, Transcription Factor 4 Octamer-Binding Protein 9 BRN-4 OCT-9 Brn-4 Oct-9
Location (GRCh38)
X:83508290-83512127
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Mechanical injury analysis
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_000307.5
Sequence length
3838.0 nt
GC content
0.4964

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-1277.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -1344.81 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 903.59
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_000307.5 NCBI
GCCACAUUAUAACUAGUAGGGGAUCCUCACCGACCAUGGCCACAGCUGC… 3838 nt 0.4964
Summary

This gene encodes a member of the POU-III class of neural transcription factors. This family member plays a role in inner ear development. The protein is thought to be involved in the mediation of epigenetic signals which induce striatal neuron-precursor differentiation. Mutations in this gene are associated with X chromosome-linked nonsyndromic mixed deafness. [provided by RefSeq, Dec 2012]

Forensic Context

A study in human leukocytes from severe burn patients identified the POU3F4 as a transcription factor with sustained increased expression post-burn, suggesting it may be a driver for inducing the immunosuppressive state during recovery [Xu et al. DOI:10.1159/000493451].