Basic Information

Symbol
POU4F3
RNA class
mRNA
Alias
POU Class 4 Homeobox 3 BRN3C Brain-Specific Homeobox/POU Domain Protein 3C POU Domain, Class 4, Transcription Factor 3 Deafness, Autosomal Dominant 42 Brain-3C DFNA15 DFNA42 DFNA52 Brn-3C POU Domain Class 4, Transcription Factor 3 Deafness, Autosomal Dominant 52
Location (GRCh38)
5:146338648-146341728
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Other applications
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_002700.3
Sequence length
2575.0 nt
GC content
0.5503

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-933.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -978.28 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 735.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_002700.3 NCBI
GGGCGCAGAAAGGCGCGCCGCUAGCUGCUGUCUCUCCUCACCUCCCGGG… 2575 nt 0.5503
Summary

This gene encodes a member of the POU-domain family of transcription factors. POU-domain proteins have been observed to play important roles in control of cell identity in several systems. This protein is found in the retina and may play a role in determining or maintaining the identities of a small subset of visual system neurons. Defects in this gene are the cause of non-syndromic sensorineural deafness autosomal dominant type 15. [provided by RefSeq, Mar 2009]

Forensic Context

A study in humans demonstrated that the POU4F3 was identified as a high-confidence gene in common between mice and humans within the top 10% of genes related to lifetime alcohol consumption [Farris et al. DOI:10.1038/Mp.2014.159].