Basic Information

Symbol
PPARG
RNA class
mRNA
Alias
Peroxisome Proliferator Activated Receptor Gamma NR1C3 Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Gamma PPARgamma PPARG1 PPARG2 Nuclear Receptor Subfamily 1 Group C Member 3 PPAR-Gamma Peroxisome Proliferator-Activated Receptor-Gamma Splicing Peroxisome Proliferative Activated Receptor, Gamma Peroxisome Proliferator-Activated Receptor-Gamma 5 PPARG5 CIMT1 FPLD3 GLM1
Location (GRCh38)
3:12287368-12434574
UCSC Genome Browser Search in Marker Scope
Forensic tag(s)
Sudden cardiac death diagnosis Wound age identification
External database
HGNC NCBI Ensembl OMIM UniProt GTEx

MANE select

Transcript ID
NM_138711.6
Sequence length
1774.0 nt
GC content
0.4453

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-495.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free energy: -528.68 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 466.13
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Transcripts

ID Sequence Length GC content
NM_001374265.1 NCBI
AGUCCUUUCUGUGUUUAUUCCCAUCUCUCCCAAAUAUUUGGAAACUGAU… 1442 nt 0.4341
NM_001374266.1 NCBI
GCCUUAACCUCUGCUGGUGACCAGAAGCCUGCAUUUCUGCAUUCUGCUU… 1241 nt 0.4416
NM_005037.7 NCBI
GGGCCCGGCUCGGCCCGACCCGGCUCCGCCGCGGGCAGGCGGGGCCCAG… 1782 nt 0.4792
NM_015869.5 NCBI
AGUCCUUUCUGUGUUUAUUCCCAUCUCUCCCAAAUAUUUGGAAACUGAU… 1893 nt 0.4385
NM_138711.6 NCBI
GCCUUAACCUCUGCUGGUGACCAGAAGCCUGCAUUUCUGCAUUCUGCUU… 1774 nt 0.4453
NM_138712.5 NCBI
GGGCCCGGCUCGGCCCGACCCGGCUCCGCCGCGGGCAGGCGGGGCCCAG… 1856 nt 0.4752
Showing 11 to 16 of 16 entries
Summary

This gene encodes a member of the peroxisome proliferator-activated receptor (PPAR) subfamily of nuclear receptors. PPARs form heterodimers with retinoid X receptors (RXRs) and these heterodimers regulate transcription of various genes. Three subtypes of PPARs are known: PPAR-alpha, PPAR-delta, and PPAR-gamma. The protein encoded by this gene is PPAR-gamma and is a regulator of adipocyte differentiation. Additionally, PPAR-gamma has been implicated in the pathology of numerous diseases including obesity, diabetes, atherosclerosis and cancer. Alternatively spliced transcript variants that encode different isoforms have been described. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Forensic Context

A study in human patients with acute myocardial infarction identified the PPARG as one of five hub genes involved in disease progression, where it was significantly positively correlated with hematopoietic stem cell types and negatively correlated with T cells and B cells [Song et al. DOI:10.3389/fpubh.2022.894129]. A review of studies in mice, rats, and humans indicates that the PPARG is found at wound edges after skin injury and its activation by agonists like rosiglitazone or 15d-PGJ2 exerts strong antiinflammatory, antifibrotic, and antiapoptotic effects across multiple organs including kidney, lung, liver, brain, and heart, largely via inhibition of NF-κB and other pro-inflammatory pathways [Michalik, L.; Wahli, W. DOI:10.1172/JCI27958].